Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GNPDA2Q8TDQ7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GNPDA2Q8TDQ7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GNPDA2Q8TDQ7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GNPDA2Q8TDQ7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNPDA2Q8TDQ7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GNPDA2Q8TDQ7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GNPDA2Q8TDQ7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GNPDA2Q8TDQ7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GNPDA2Q8TDQ7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GNPDA2Q8TDQ7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GNPDA2Q8TDQ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GNPDA2Q8TDQ7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GNPDA2Q8TDQ7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GNPDA2Q8TDQ7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GNPDA2Q8TDQ7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GNPDA2Q8TDQ7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GNPDA2Q8TDQ7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GNPDA2Q8TDQ7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GNPDA2Q8TDQ7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GNPDA2Q8TDQ7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GNPDA2Q8TDQ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GNPDA2Q8TDQ7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GNPDA2Q8TDQ7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GNPDA2Q8TDQ7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GNPDA2Q8TDQ7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GNPDA2Q8TDQ7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GNPDA2Q8TDQ7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GNPDA2Q8TDQ7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GNPDA2Q8TDQ7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GNPDA2Q8TDQ7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GNPDA2Q8TDQ7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GNPDA2Q8TDQ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GNPDA2Q8TDQ7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GNPDA2Q8TDQ7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GNPDA2Q8TDQ7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GNPDA2Q8TDQ7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GNPDA2Q8TDQ7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GNPDA2Q8TDQ7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GNPDA2Q8TDQ7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GNPDA2Q8TDQ7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GNPDA2Q8TDQ7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GNPDA2Q8TDQ7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GNPDA2Q8TDQ7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GNPDA2Q8TDQ7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GNPDA2Q8TDQ7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GNPDA2Q8TDQ7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GNPDA2Q8TDQ7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GNPDA2Q8TDQ7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GNPDA2Q8TDQ7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GNPDA2Q8TDQ7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GNPDA2Q8TDQ7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GNPDA2Q8TDQ7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GNPDA2Q8TDQ7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GNPDA2Q8TDQ7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GNPDA2Q8TDQ7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GNPDA2Q8TDQ7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GNPDA2Q8TDQ7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GNPDA2Q8TDQ7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GNPDA2Q8TDQ7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GNPDA2Q8TDQ7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GNPDA2Q8TDQ7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GNPDA2Q8TDQ7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GNPDA2Q8TDQ7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GNPDA2Q8TDQ7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GNPDA2Q8TDQ7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNPDA2Q8TDQ7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNPDA2Q8TDQ7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GNPDA2Q8TDQ7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNPDA2Q8TDQ7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNPDA2Q8TDQ7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNPDA2Q8TDQ7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GNPDA2Q8TDQ7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GNPDA2Q8TDQ7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GNPDA2Q8TDQ7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNPDA2Q8TDQ7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNPDA2Q8TDQ7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNPDA2Q8TDQ7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNPDA2Q8TDQ7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GNPDA2Q8TDQ7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GNPDA2Q8TDQ7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GNPDA2Q8TDQ7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GNPDA2Q8TDQ7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GNPDA2Q8TDQ7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNPDA2Q8TDQ7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNPDA2Q8TDQ7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GNPDA2Q8TDQ7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GNPDA2Q8TDQ7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNPDA2Q8TDQ7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GNPDA2Q8TDQ7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GNPDA2Q8TDQ7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GNPDA2Q8TDQ7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GNPDA2Q8TDQ7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNPDA2Q8TDQ7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNPDA2Q8TDQ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNPDA2Q8TDQ7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GNPDA2Q8TDQ7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms