Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHD5Q8TDI0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHD5Q8TDI0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHD5Q8TDI0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHD5Q8TDI0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHD5Q8TDI0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHD5Q8TDI0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHD5Q8TDI0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHD5Q8TDI0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CHD5Q8TDI0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD5Q8TDI0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD5Q8TDI0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD5Q8TDI0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD5Q8TDI0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHD5Q8TDI0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHD5Q8TDI0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHD5Q8TDI0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CHD5Q8TDI0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHD5Q8TDI0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD5Q8TDI0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD5Q8TDI0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD5Q8TDI0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD5Q8TDI0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD5Q8TDI0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD5Q8TDI0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHD5Q8TDI0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHD5Q8TDI0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHD5Q8TDI0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHD5Q8TDI0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHD5Q8TDI0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHD5Q8TDI0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CHD5Q8TDI0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHD5Q8TDI0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CHD5Q8TDI0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHD5Q8TDI0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHD5Q8TDI0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHD5Q8TDI0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHD5Q8TDI0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHD5Q8TDI0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHD5Q8TDI0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD5Q8TDI0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD5Q8TDI0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHD5Q8TDI0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHD5Q8TDI0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHD5Q8TDI0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHD5Q8TDI0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHD5Q8TDI0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHD5Q8TDI0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHD5Q8TDI0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD5Q8TDI0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD5Q8TDI0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD5Q8TDI0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD5Q8TDI0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHD5Q8TDI0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CHD5Q8TDI0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHD5Q8TDI0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHD5Q8TDI0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHD5Q8TDI0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHD5Q8TDI0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHD5Q8TDI0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHD5Q8TDI0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHD5Q8TDI0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD5Q8TDI0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD5Q8TDI0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHD5Q8TDI0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHD5Q8TDI0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHD5Q8TDI0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHD5Q8TDI0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHD5Q8TDI0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHD5Q8TDI0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHD5Q8TDI0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHD5Q8TDI0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHD5Q8TDI0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHD5Q8TDI0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHD5Q8TDI0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHD5Q8TDI0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHD5Q8TDI0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms