Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIPK4Q8NE63 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIPK4Q8NE63 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIPK4Q8NE63 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIPK4Q8NE63 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIPK4Q8NE63 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIPK4Q8NE63 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIPK4Q8NE63 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIPK4Q8NE63 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIPK4Q8NE63 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIPK4Q8NE63 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIPK4Q8NE63 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIPK4Q8NE63 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HIPK4Q8NE63 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIPK4Q8NE63 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HIPK4Q8NE63 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIPK4Q8NE63 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIPK4Q8NE63 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIPK4Q8NE63 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIPK4Q8NE63 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIPK4Q8NE63 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HIPK4Q8NE63 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIPK4Q8NE63 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HIPK4Q8NE63 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HIPK4Q8NE63 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIPK4Q8NE63 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HIPK4Q8NE63 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HIPK4Q8NE63 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIPK4Q8NE63 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIPK4Q8NE63 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIPK4Q8NE63 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HIPK4Q8NE63 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HIPK4Q8NE63 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIPK4Q8NE63 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIPK4Q8NE63 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HIPK4Q8NE63 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIPK4Q8NE63 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIPK4Q8NE63 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIPK4Q8NE63 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HIPK4Q8NE63 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HIPK4Q8NE63 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIPK4Q8NE63 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HIPK4Q8NE63 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIPK4Q8NE63 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIPK4Q8NE63 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIPK4Q8NE63 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIPK4Q8NE63 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIPK4Q8NE63 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIPK4Q8NE63 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIPK4Q8NE63 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HIPK4Q8NE63 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIPK4Q8NE63 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HIPK4Q8NE63 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIPK4Q8NE63 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIPK4Q8NE63 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIPK4Q8NE63 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HIPK4Q8NE63 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HIPK4Q8NE63 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HIPK4Q8NE63 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIPK4Q8NE63 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIPK4Q8NE63 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIPK4Q8NE63 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIPK4Q8NE63 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIPK4Q8NE63 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIPK4Q8NE63 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIPK4Q8NE63 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIPK4Q8NE63 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIPK4Q8NE63 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIPK4Q8NE63 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIPK4Q8NE63 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIPK4Q8NE63 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms