Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDH2

CCDC168, Coiled-coil domain-containing protein 168, humanhuman

Predictions only

Length 2,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC168Q8NDH2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC168Q8NDH2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC168Q8NDH2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC168Q8NDH2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC168Q8NDH2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC168Q8NDH2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC168Q8NDH2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC168Q8NDH2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC168Q8NDH2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC168Q8NDH2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC168Q8NDH2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC168Q8NDH2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC168Q8NDH2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC168Q8NDH2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC168Q8NDH2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC168Q8NDH2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC168Q8NDH2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC168Q8NDH2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC168Q8NDH2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC168Q8NDH2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC168Q8NDH2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC168Q8NDH2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC168Q8NDH2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC168Q8NDH2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC168Q8NDH2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC168Q8NDH2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC168Q8NDH2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC168Q8NDH2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC168Q8NDH2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC168Q8NDH2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC168Q8NDH2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC168Q8NDH2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC168Q8NDH2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC168Q8NDH2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC168Q8NDH2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC168Q8NDH2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC168Q8NDH2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC168Q8NDH2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC168Q8NDH2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC168Q8NDH2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC168Q8NDH2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC168Q8NDH2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC168Q8NDH2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC168Q8NDH2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC168Q8NDH2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC168Q8NDH2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC168Q8NDH2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC168Q8NDH2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC168Q8NDH2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC168Q8NDH2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC168Q8NDH2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC168Q8NDH2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC168Q8NDH2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC168Q8NDH2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC168Q8NDH2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC168Q8NDH2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC168Q8NDH2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC168Q8NDH2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC168Q8NDH2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC168Q8NDH2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC168Q8NDH2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC168Q8NDH2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC168Q8NDH2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC168Q8NDH2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC168Q8NDH2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC168Q8NDH2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC168Q8NDH2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC168Q8NDH2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC168Q8NDH2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC168Q8NDH2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC168Q8NDH2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC168Q8NDH2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC168Q8NDH2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms