Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMD12Q8N8I0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMD12Q8N8I0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMD12Q8N8I0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD12Q8N8I0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD12Q8N8I0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD12Q8N8I0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD12Q8N8I0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD12Q8N8I0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD12Q8N8I0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD12Q8N8I0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD12Q8N8I0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD12Q8N8I0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD12Q8N8I0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD12Q8N8I0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD12Q8N8I0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD12Q8N8I0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD12Q8N8I0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD12Q8N8I0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD12Q8N8I0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD12Q8N8I0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD12Q8N8I0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD12Q8N8I0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD12Q8N8I0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD12Q8N8I0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD12Q8N8I0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMD12Q8N8I0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMD12Q8N8I0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMD12Q8N8I0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD12Q8N8I0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD12Q8N8I0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD12Q8N8I0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD12Q8N8I0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD12Q8N8I0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD12Q8N8I0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD12Q8N8I0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD12Q8N8I0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD12Q8N8I0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD12Q8N8I0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD12Q8N8I0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD12Q8N8I0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD12Q8N8I0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD12Q8N8I0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD12Q8N8I0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD12Q8N8I0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD12Q8N8I0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD12Q8N8I0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD12Q8N8I0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD12Q8N8I0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD12Q8N8I0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD12Q8N8I0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD12Q8N8I0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD12Q8N8I0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD12Q8N8I0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD12Q8N8I0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD12Q8N8I0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD12Q8N8I0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD12Q8N8I0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD12Q8N8I0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD12Q8N8I0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD12Q8N8I0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD12Q8N8I0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD12Q8N8I0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD12Q8N8I0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD12Q8N8I0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD12Q8N8I0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD12Q8N8I0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD12Q8N8I0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD12Q8N8I0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD12Q8N8I0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD12Q8N8I0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD12Q8N8I0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD12Q8N8I0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD12Q8N8I0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD12Q8N8I0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD12Q8N8I0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD12Q8N8I0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD12Q8N8I0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD12Q8N8I0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD12Q8N8I0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SAMD12Q8N8I0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAMD12Q8N8I0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SAMD12Q8N8I0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD12Q8N8I0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SAMD12Q8N8I0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SAMD12Q8N8I0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD12Q8N8I0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAMD12Q8N8I0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD12Q8N8I0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD12Q8N8I0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD12Q8N8I0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAMD12Q8N8I0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD12Q8N8I0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD12Q8N8I0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD12Q8N8I0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAMD12Q8N8I0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD12Q8N8I0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAMD12Q8N8I0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SAMD12Q8N8I0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SAMD12Q8N8I0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms