Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3Z3

GTPBP8, GTP-binding protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP8Q8N3Z3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTPBP8Q8N3Z3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTPBP8Q8N3Z3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GTPBP8Q8N3Z3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTPBP8Q8N3Z3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTPBP8Q8N3Z3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTPBP8Q8N3Z3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTPBP8Q8N3Z3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTPBP8Q8N3Z3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTPBP8Q8N3Z3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GTPBP8Q8N3Z3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTPBP8Q8N3Z3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTPBP8Q8N3Z3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTPBP8Q8N3Z3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTPBP8Q8N3Z3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTPBP8Q8N3Z3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTPBP8Q8N3Z3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP8Q8N3Z3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP8Q8N3Z3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTPBP8Q8N3Z3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTPBP8Q8N3Z3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTPBP8Q8N3Z3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTPBP8Q8N3Z3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTPBP8Q8N3Z3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTPBP8Q8N3Z3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GTPBP8Q8N3Z3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTPBP8Q8N3Z3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTPBP8Q8N3Z3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTPBP8Q8N3Z3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTPBP8Q8N3Z3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTPBP8Q8N3Z3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTPBP8Q8N3Z3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTPBP8Q8N3Z3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTPBP8Q8N3Z3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTPBP8Q8N3Z3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTPBP8Q8N3Z3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GTPBP8Q8N3Z3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTPBP8Q8N3Z3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTPBP8Q8N3Z3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTPBP8Q8N3Z3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP8Q8N3Z3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP8Q8N3Z3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP8Q8N3Z3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP8Q8N3Z3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP8Q8N3Z3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP8Q8N3Z3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTPBP8Q8N3Z3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTPBP8Q8N3Z3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTPBP8Q8N3Z3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTPBP8Q8N3Z3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTPBP8Q8N3Z3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTPBP8Q8N3Z3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP8Q8N3Z3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTPBP8Q8N3Z3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP8Q8N3Z3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP8Q8N3Z3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP8Q8N3Z3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTPBP8Q8N3Z3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP8Q8N3Z3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP8Q8N3Z3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTPBP8Q8N3Z3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTPBP8Q8N3Z3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTPBP8Q8N3Z3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTPBP8Q8N3Z3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTPBP8Q8N3Z3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GTPBP8Q8N3Z3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTPBP8Q8N3Z3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTPBP8Q8N3Z3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTPBP8Q8N3Z3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTPBP8Q8N3Z3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTPBP8Q8N3Z3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GTPBP8Q8N3Z3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTPBP8Q8N3Z3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTPBP8Q8N3Z3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTPBP8Q8N3Z3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTPBP8Q8N3Z3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTPBP8Q8N3Z3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms