Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXL6

FAM20C, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20CQ8IXL6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM20CQ8IXL6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM20CQ8IXL6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM20CQ8IXL6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM20CQ8IXL6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM20CQ8IXL6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM20CQ8IXL6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM20CQ8IXL6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM20CQ8IXL6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM20CQ8IXL6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM20CQ8IXL6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM20CQ8IXL6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM20CQ8IXL6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM20CQ8IXL6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM20CQ8IXL6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM20CQ8IXL6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM20CQ8IXL6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM20CQ8IXL6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM20CQ8IXL6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM20CQ8IXL6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM20CQ8IXL6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM20CQ8IXL6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM20CQ8IXL6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM20CQ8IXL6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM20CQ8IXL6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM20CQ8IXL6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM20CQ8IXL6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM20CQ8IXL6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM20CQ8IXL6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM20CQ8IXL6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM20CQ8IXL6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM20CQ8IXL6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM20CQ8IXL6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM20CQ8IXL6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM20CQ8IXL6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM20CQ8IXL6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM20CQ8IXL6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM20CQ8IXL6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM20CQ8IXL6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM20CQ8IXL6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM20CQ8IXL6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM20CQ8IXL6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM20CQ8IXL6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM20CQ8IXL6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM20CQ8IXL6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FAM20CQ8IXL6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM20CQ8IXL6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM20CQ8IXL6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM20CQ8IXL6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM20CQ8IXL6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM20CQ8IXL6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM20CQ8IXL6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM20CQ8IXL6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM20CQ8IXL6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM20CQ8IXL6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM20CQ8IXL6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM20CQ8IXL6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM20CQ8IXL6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM20CQ8IXL6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM20CQ8IXL6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM20CQ8IXL6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM20CQ8IXL6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM20CQ8IXL6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM20CQ8IXL6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM20CQ8IXL6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM20CQ8IXL6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM20CQ8IXL6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM20CQ8IXL6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM20CQ8IXL6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM20CQ8IXL6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM20CQ8IXL6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM20CQ8IXL6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM20CQ8IXL6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM20CQ8IXL6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM20CQ8IXL6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM20CQ8IXL6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM20CQ8IXL6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM20CQ8IXL6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM20CQ8IXL6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM20CQ8IXL6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM20CQ8IXL6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM20CQ8IXL6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM20CQ8IXL6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM20CQ8IXL6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM20CQ8IXL6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM20CQ8IXL6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM20CQ8IXL6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM20CQ8IXL6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM20CQ8IXL6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAM20CQ8IXL6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM20CQ8IXL6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM20CQ8IXL6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM20CQ8IXL6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM20CQ8IXL6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM20CQ8IXL6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM20CQ8IXL6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM20CQ8IXL6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM20CQ8IXL6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM20CQ8IXL6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM20CQ8IXL6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms