Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV61

RASGRP3, Ras guanyl-releasing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRP3Q8IV61 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRP3Q8IV61 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRP3Q8IV61 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRP3Q8IV61 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRP3Q8IV61 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRP3Q8IV61 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRP3Q8IV61 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASGRP3Q8IV61 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASGRP3Q8IV61 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASGRP3Q8IV61 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASGRP3Q8IV61 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASGRP3Q8IV61 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRP3Q8IV61 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRP3Q8IV61 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRP3Q8IV61 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASGRP3Q8IV61 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGRP3Q8IV61 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASGRP3Q8IV61 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGRP3Q8IV61 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGRP3Q8IV61 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGRP3Q8IV61 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RASGRP3Q8IV61 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASGRP3Q8IV61 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASGRP3Q8IV61 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASGRP3Q8IV61 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASGRP3Q8IV61 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASGRP3Q8IV61 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASGRP3Q8IV61 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASGRP3Q8IV61 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASGRP3Q8IV61 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASGRP3Q8IV61 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASGRP3Q8IV61 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGRP3Q8IV61 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGRP3Q8IV61 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGRP3Q8IV61 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGRP3Q8IV61 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGRP3Q8IV61 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGRP3Q8IV61 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASGRP3Q8IV61 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RASGRP3Q8IV61 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RASGRP3Q8IV61 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASGRP3Q8IV61 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASGRP3Q8IV61 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASGRP3Q8IV61 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASGRP3Q8IV61 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASGRP3Q8IV61 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASGRP3Q8IV61 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASGRP3Q8IV61 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASGRP3Q8IV61 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASGRP3Q8IV61 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASGRP3Q8IV61 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASGRP3Q8IV61 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASGRP3Q8IV61 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASGRP3Q8IV61 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASGRP3Q8IV61 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASGRP3Q8IV61 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASGRP3Q8IV61 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASGRP3Q8IV61 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASGRP3Q8IV61 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASGRP3Q8IV61 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASGRP3Q8IV61 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASGRP3Q8IV61 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASGRP3Q8IV61 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASGRP3Q8IV61 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASGRP3Q8IV61 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASGRP3Q8IV61 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASGRP3Q8IV61 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASGRP3Q8IV61 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASGRP3Q8IV61 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASGRP3Q8IV61 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASGRP3Q8IV61 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RASGRP3Q8IV61 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASGRP3Q8IV61 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASGRP3Q8IV61 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASGRP3Q8IV61 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASGRP3Q8IV61 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RASGRP3Q8IV61 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms