Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU7

SETD3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD3Q86TU7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD3Q86TU7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD3Q86TU7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD3Q86TU7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD3Q86TU7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETD3Q86TU7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD3Q86TU7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SETD3Q86TU7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD3Q86TU7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD3Q86TU7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD3Q86TU7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD3Q86TU7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD3Q86TU7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD3Q86TU7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETD3Q86TU7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETD3Q86TU7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD3Q86TU7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD3Q86TU7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETD3Q86TU7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD3Q86TU7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD3Q86TU7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SETD3Q86TU7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETD3Q86TU7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETD3Q86TU7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SETD3Q86TU7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SETD3Q86TU7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SETD3Q86TU7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SETD3Q86TU7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SETD3Q86TU7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SETD3Q86TU7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SETD3Q86TU7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SETD3Q86TU7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SETD3Q86TU7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SETD3Q86TU7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SETD3Q86TU7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SETD3Q86TU7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SETD3Q86TU7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SETD3Q86TU7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SETD3Q86TU7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SETD3Q86TU7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SETD3Q86TU7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD3Q86TU7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD3Q86TU7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD3Q86TU7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD3Q86TU7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD3Q86TU7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD3Q86TU7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD3Q86TU7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD3Q86TU7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD3Q86TU7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SETD3Q86TU7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD3Q86TU7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD3Q86TU7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD3Q86TU7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD3Q86TU7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD3Q86TU7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD3Q86TU7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD3Q86TU7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD3Q86TU7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD3Q86TU7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD3Q86TU7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD3Q86TU7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD3Q86TU7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SETD3Q86TU7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SETD3Q86TU7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SETD3Q86TU7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD3Q86TU7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD3Q86TU7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD3Q86TU7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD3Q86TU7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD3Q86TU7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD3Q86TU7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD3Q86TU7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD3Q86TU7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD3Q86TU7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms