Protein–RNA interactions for Protein: Q86SG4

HMGN2P46, Putative Dresden prostate carcinoma protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN2P46Q86SG4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGN2P46Q86SG4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGN2P46Q86SG4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGN2P46Q86SG4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGN2P46Q86SG4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGN2P46Q86SG4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGN2P46Q86SG4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGN2P46Q86SG4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGN2P46Q86SG4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGN2P46Q86SG4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGN2P46Q86SG4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGN2P46Q86SG4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGN2P46Q86SG4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGN2P46Q86SG4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGN2P46Q86SG4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGN2P46Q86SG4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGN2P46Q86SG4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGN2P46Q86SG4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGN2P46Q86SG4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGN2P46Q86SG4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGN2P46Q86SG4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGN2P46Q86SG4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGN2P46Q86SG4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGN2P46Q86SG4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGN2P46Q86SG4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGN2P46Q86SG4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGN2P46Q86SG4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGN2P46Q86SG4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGN2P46Q86SG4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGN2P46Q86SG4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGN2P46Q86SG4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HMGN2P46Q86SG4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGN2P46Q86SG4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGN2P46Q86SG4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMGN2P46Q86SG4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGN2P46Q86SG4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMGN2P46Q86SG4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGN2P46Q86SG4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGN2P46Q86SG4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGN2P46Q86SG4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGN2P46Q86SG4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGN2P46Q86SG4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGN2P46Q86SG4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMGN2P46Q86SG4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGN2P46Q86SG4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMGN2P46Q86SG4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGN2P46Q86SG4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGN2P46Q86SG4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGN2P46Q86SG4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMGN2P46Q86SG4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMGN2P46Q86SG4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGN2P46Q86SG4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMGN2P46Q86SG4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms