Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3X8

PGBD2, PiggyBac transposable element-derived protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD2Q6P3X8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD2Q6P3X8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD2Q6P3X8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD2Q6P3X8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD2Q6P3X8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD2Q6P3X8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD2Q6P3X8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD2Q6P3X8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD2Q6P3X8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD2Q6P3X8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD2Q6P3X8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD2Q6P3X8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD2Q6P3X8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD2Q6P3X8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD2Q6P3X8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGBD2Q6P3X8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGBD2Q6P3X8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGBD2Q6P3X8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGBD2Q6P3X8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGBD2Q6P3X8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PGBD2Q6P3X8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGBD2Q6P3X8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGBD2Q6P3X8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD2Q6P3X8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD2Q6P3X8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD2Q6P3X8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD2Q6P3X8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD2Q6P3X8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD2Q6P3X8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD2Q6P3X8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGBD2Q6P3X8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGBD2Q6P3X8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD2Q6P3X8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD2Q6P3X8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD2Q6P3X8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD2Q6P3X8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD2Q6P3X8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD2Q6P3X8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD2Q6P3X8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD2Q6P3X8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD2Q6P3X8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD2Q6P3X8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD2Q6P3X8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD2Q6P3X8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD2Q6P3X8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD2Q6P3X8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD2Q6P3X8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD2Q6P3X8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGBD2Q6P3X8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGBD2Q6P3X8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGBD2Q6P3X8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PGBD2Q6P3X8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGBD2Q6P3X8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD2Q6P3X8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD2Q6P3X8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD2Q6P3X8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD2Q6P3X8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD2Q6P3X8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGBD2Q6P3X8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGBD2Q6P3X8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGBD2Q6P3X8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGBD2Q6P3X8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGBD2Q6P3X8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGBD2Q6P3X8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PGBD2Q6P3X8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PGBD2Q6P3X8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PGBD2Q6P3X8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGBD2Q6P3X8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGBD2Q6P3X8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGBD2Q6P3X8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGBD2Q6P3X8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGBD2Q6P3X8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGBD2Q6P3X8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGBD2Q6P3X8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGBD2Q6P3X8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGBD2Q6P3X8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGBD2Q6P3X8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGBD2Q6P3X8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGBD2Q6P3X8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGBD2Q6P3X8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGBD2Q6P3X8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGBD2Q6P3X8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGBD2Q6P3X8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGBD2Q6P3X8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGBD2Q6P3X8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGBD2Q6P3X8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGBD2Q6P3X8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD2Q6P3X8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGBD2Q6P3X8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD2Q6P3X8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD2Q6P3X8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD2Q6P3X8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD2Q6P3X8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGBD2Q6P3X8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD2Q6P3X8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD2Q6P3X8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD2Q6P3X8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD2Q6P3X8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD2Q6P3X8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGBD2Q6P3X8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms