Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.733e-21■■■■■ 78.4
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PRPF8Q6P2Q9 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.823e-21■■■■■ 78.4
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PRPF8Q6P2Q9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.031e-7■■■■■ 75.6
PRPF8Q6P2Q9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.127e-10■■■■■ 75.6
PRPF8Q6P2Q9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.177e-10■■■■■ 75.6
PRPF8Q6P2Q9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.27e-10■■■■■ 75.6
PRPF8Q6P2Q9 SIL1-204ENST00000503732 690 ntTSL 312.51□□□□□ -0.417e-10■■■■■ 75.6
PRPF8Q6P2Q9 SIL1-208ENST00000505945 250 ntTSL 1 (best)9.96□□□□□ -0.817e-10■■■■■ 75.6
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PRPF8Q6P2Q9 INTS8-208ENST00000520845 554 ntTSL 33.88□□□□□ -1.793e-8■■■■■ 74.7
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