Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC1

JMJD6, Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD6Q6NYC1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
JMJD6Q6NYC1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
JMJD6Q6NYC1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
JMJD6Q6NYC1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
JMJD6Q6NYC1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
JMJD6Q6NYC1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
JMJD6Q6NYC1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
JMJD6Q6NYC1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
JMJD6Q6NYC1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JMJD6Q6NYC1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JMJD6Q6NYC1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JMJD6Q6NYC1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
JMJD6Q6NYC1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
JMJD6Q6NYC1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
JMJD6Q6NYC1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
JMJD6Q6NYC1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
JMJD6Q6NYC1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
JMJD6Q6NYC1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
JMJD6Q6NYC1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
JMJD6Q6NYC1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
JMJD6Q6NYC1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
JMJD6Q6NYC1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JMJD6Q6NYC1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
JMJD6Q6NYC1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JMJD6Q6NYC1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
JMJD6Q6NYC1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JMJD6Q6NYC1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JMJD6Q6NYC1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JMJD6Q6NYC1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JMJD6Q6NYC1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
JMJD6Q6NYC1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JMJD6Q6NYC1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
JMJD6Q6NYC1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
JMJD6Q6NYC1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
JMJD6Q6NYC1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
JMJD6Q6NYC1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.5 ms