Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GFI1BQ5VTD9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GFI1BQ5VTD9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GFI1BQ5VTD9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GFI1BQ5VTD9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GFI1BQ5VTD9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GFI1BQ5VTD9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GFI1BQ5VTD9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GFI1BQ5VTD9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GFI1BQ5VTD9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GFI1BQ5VTD9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GFI1BQ5VTD9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GFI1BQ5VTD9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GFI1BQ5VTD9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GFI1BQ5VTD9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFI1BQ5VTD9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFI1BQ5VTD9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFI1BQ5VTD9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GFI1BQ5VTD9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GFI1BQ5VTD9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GFI1BQ5VTD9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GFI1BQ5VTD9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFI1BQ5VTD9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GFI1BQ5VTD9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFI1BQ5VTD9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFI1BQ5VTD9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GFI1BQ5VTD9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GFI1BQ5VTD9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GFI1BQ5VTD9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GFI1BQ5VTD9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GFI1BQ5VTD9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GFI1BQ5VTD9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GFI1BQ5VTD9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GFI1BQ5VTD9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GFI1BQ5VTD9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GFI1BQ5VTD9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GFI1BQ5VTD9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GFI1BQ5VTD9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GFI1BQ5VTD9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GFI1BQ5VTD9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GFI1BQ5VTD9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GFI1BQ5VTD9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GFI1BQ5VTD9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GFI1BQ5VTD9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GFI1BQ5VTD9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GFI1BQ5VTD9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GFI1BQ5VTD9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GFI1BQ5VTD9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GFI1BQ5VTD9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GFI1BQ5VTD9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GFI1BQ5VTD9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GFI1BQ5VTD9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GFI1BQ5VTD9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GFI1BQ5VTD9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GFI1BQ5VTD9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GFI1BQ5VTD9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GFI1BQ5VTD9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GFI1BQ5VTD9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GFI1BQ5VTD9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFI1BQ5VTD9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFI1BQ5VTD9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFI1BQ5VTD9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFI1BQ5VTD9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GFI1BQ5VTD9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFI1BQ5VTD9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFI1BQ5VTD9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFI1BQ5VTD9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFI1BQ5VTD9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFI1BQ5VTD9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFI1BQ5VTD9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFI1BQ5VTD9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFI1BQ5VTD9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFI1BQ5VTD9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFI1BQ5VTD9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFI1BQ5VTD9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFI1BQ5VTD9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms