Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGSNQ5TDP6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LGSNQ5TDP6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LGSNQ5TDP6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LGSNQ5TDP6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGSNQ5TDP6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LGSNQ5TDP6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LGSNQ5TDP6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LGSNQ5TDP6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LGSNQ5TDP6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LGSNQ5TDP6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LGSNQ5TDP6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LGSNQ5TDP6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LGSNQ5TDP6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LGSNQ5TDP6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LGSNQ5TDP6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LGSNQ5TDP6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LGSNQ5TDP6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LGSNQ5TDP6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LGSNQ5TDP6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LGSNQ5TDP6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LGSNQ5TDP6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LGSNQ5TDP6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LGSNQ5TDP6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LGSNQ5TDP6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LGSNQ5TDP6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LGSNQ5TDP6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LGSNQ5TDP6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LGSNQ5TDP6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LGSNQ5TDP6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LGSNQ5TDP6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LGSNQ5TDP6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LGSNQ5TDP6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LGSNQ5TDP6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LGSNQ5TDP6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LGSNQ5TDP6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LGSNQ5TDP6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LGSNQ5TDP6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LGSNQ5TDP6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LGSNQ5TDP6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LGSNQ5TDP6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LGSNQ5TDP6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LGSNQ5TDP6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LGSNQ5TDP6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LGSNQ5TDP6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LGSNQ5TDP6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LGSNQ5TDP6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LGSNQ5TDP6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LGSNQ5TDP6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LGSNQ5TDP6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LGSNQ5TDP6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LGSNQ5TDP6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LGSNQ5TDP6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LGSNQ5TDP6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LGSNQ5TDP6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LGSNQ5TDP6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LGSNQ5TDP6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LGSNQ5TDP6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LGSNQ5TDP6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LGSNQ5TDP6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LGSNQ5TDP6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LGSNQ5TDP6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LGSNQ5TDP6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LGSNQ5TDP6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LGSNQ5TDP6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LGSNQ5TDP6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LGSNQ5TDP6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LGSNQ5TDP6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LGSNQ5TDP6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LGSNQ5TDP6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LGSNQ5TDP6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LGSNQ5TDP6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LGSNQ5TDP6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LGSNQ5TDP6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LGSNQ5TDP6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LGSNQ5TDP6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LGSNQ5TDP6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LGSNQ5TDP6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LGSNQ5TDP6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LGSNQ5TDP6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LGSNQ5TDP6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LGSNQ5TDP6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LGSNQ5TDP6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LGSNQ5TDP6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LGSNQ5TDP6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LGSNQ5TDP6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LGSNQ5TDP6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LGSNQ5TDP6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LGSNQ5TDP6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LGSNQ5TDP6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LGSNQ5TDP6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LGSNQ5TDP6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LGSNQ5TDP6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LGSNQ5TDP6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LGSNQ5TDP6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LGSNQ5TDP6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LGSNQ5TDP6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LGSNQ5TDP6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LGSNQ5TDP6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LGSNQ5TDP6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms