Protein–RNA interactions for Protein: Q5TBK1

N4BP2L1, NEDD4-binding protein 2-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2L1Q5TBK1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
N4BP2L1Q5TBK1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
N4BP2L1Q5TBK1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
N4BP2L1Q5TBK1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
N4BP2L1Q5TBK1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
N4BP2L1Q5TBK1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
N4BP2L1Q5TBK1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
N4BP2L1Q5TBK1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
N4BP2L1Q5TBK1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
N4BP2L1Q5TBK1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
N4BP2L1Q5TBK1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
N4BP2L1Q5TBK1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
N4BP2L1Q5TBK1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
N4BP2L1Q5TBK1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
N4BP2L1Q5TBK1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
N4BP2L1Q5TBK1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
N4BP2L1Q5TBK1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
N4BP2L1Q5TBK1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
N4BP2L1Q5TBK1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
N4BP2L1Q5TBK1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
N4BP2L1Q5TBK1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
N4BP2L1Q5TBK1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
N4BP2L1Q5TBK1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
N4BP2L1Q5TBK1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
N4BP2L1Q5TBK1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
N4BP2L1Q5TBK1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
N4BP2L1Q5TBK1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
N4BP2L1Q5TBK1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
N4BP2L1Q5TBK1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
N4BP2L1Q5TBK1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
N4BP2L1Q5TBK1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
N4BP2L1Q5TBK1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
N4BP2L1Q5TBK1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
N4BP2L1Q5TBK1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
N4BP2L1Q5TBK1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
N4BP2L1Q5TBK1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
N4BP2L1Q5TBK1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
N4BP2L1Q5TBK1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
N4BP2L1Q5TBK1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
N4BP2L1Q5TBK1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
N4BP2L1Q5TBK1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
N4BP2L1Q5TBK1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
N4BP2L1Q5TBK1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
N4BP2L1Q5TBK1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
N4BP2L1Q5TBK1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
N4BP2L1Q5TBK1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP2L1Q5TBK1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP2L1Q5TBK1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP2L1Q5TBK1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP2L1Q5TBK1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP2L1Q5TBK1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP2L1Q5TBK1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
N4BP2L1Q5TBK1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP2L1Q5TBK1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP2L1Q5TBK1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
N4BP2L1Q5TBK1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
N4BP2L1Q5TBK1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
N4BP2L1Q5TBK1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
N4BP2L1Q5TBK1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP2L1Q5TBK1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP2L1Q5TBK1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP2L1Q5TBK1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP2L1Q5TBK1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
N4BP2L1Q5TBK1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP2L1Q5TBK1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP2L1Q5TBK1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP2L1Q5TBK1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
N4BP2L1Q5TBK1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
N4BP2L1Q5TBK1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
N4BP2L1Q5TBK1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
N4BP2L1Q5TBK1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
N4BP2L1Q5TBK1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
N4BP2L1Q5TBK1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
N4BP2L1Q5TBK1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
N4BP2L1Q5TBK1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
N4BP2L1Q5TBK1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
N4BP2L1Q5TBK1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
N4BP2L1Q5TBK1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
N4BP2L1Q5TBK1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
N4BP2L1Q5TBK1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
N4BP2L1Q5TBK1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
N4BP2L1Q5TBK1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
N4BP2L1Q5TBK1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
N4BP2L1Q5TBK1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
N4BP2L1Q5TBK1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
N4BP2L1Q5TBK1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
N4BP2L1Q5TBK1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
N4BP2L1Q5TBK1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
N4BP2L1Q5TBK1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
N4BP2L1Q5TBK1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
N4BP2L1Q5TBK1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
N4BP2L1Q5TBK1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
N4BP2L1Q5TBK1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
N4BP2L1Q5TBK1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
N4BP2L1Q5TBK1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
N4BP2L1Q5TBK1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
N4BP2L1Q5TBK1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
N4BP2L1Q5TBK1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
N4BP2L1Q5TBK1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
N4BP2L1Q5TBK1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms