Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C10orf55Q5SWW7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C10orf55Q5SWW7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C10orf55Q5SWW7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C10orf55Q5SWW7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C10orf55Q5SWW7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C10orf55Q5SWW7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
C10orf55Q5SWW7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C10orf55Q5SWW7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C10orf55Q5SWW7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C10orf55Q5SWW7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C10orf55Q5SWW7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C10orf55Q5SWW7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C10orf55Q5SWW7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C10orf55Q5SWW7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C10orf55Q5SWW7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C10orf55Q5SWW7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C10orf55Q5SWW7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C10orf55Q5SWW7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C10orf55Q5SWW7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C10orf55Q5SWW7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C10orf55Q5SWW7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C10orf55Q5SWW7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C10orf55Q5SWW7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C10orf55Q5SWW7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C10orf55Q5SWW7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C10orf55Q5SWW7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C10orf55Q5SWW7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C10orf55Q5SWW7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C10orf55Q5SWW7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C10orf55Q5SWW7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C10orf55Q5SWW7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C10orf55Q5SWW7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C10orf55Q5SWW7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C10orf55Q5SWW7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C10orf55Q5SWW7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
C10orf55Q5SWW7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C10orf55Q5SWW7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C10orf55Q5SWW7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C10orf55Q5SWW7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C10orf55Q5SWW7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C10orf55Q5SWW7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C10orf55Q5SWW7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C10orf55Q5SWW7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C10orf55Q5SWW7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C10orf55Q5SWW7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C10orf55Q5SWW7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C10orf55Q5SWW7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
C10orf55Q5SWW7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C10orf55Q5SWW7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C10orf55Q5SWW7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C10orf55Q5SWW7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C10orf55Q5SWW7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C10orf55Q5SWW7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C10orf55Q5SWW7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C10orf55Q5SWW7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
C10orf55Q5SWW7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C10orf55Q5SWW7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C10orf55Q5SWW7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C10orf55Q5SWW7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C10orf55Q5SWW7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C10orf55Q5SWW7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C10orf55Q5SWW7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C10orf55Q5SWW7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C10orf55Q5SWW7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C10orf55Q5SWW7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C10orf55Q5SWW7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms