Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIN4Q56A73 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIN4Q56A73 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIN4Q56A73 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIN4Q56A73 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIN4Q56A73 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIN4Q56A73 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIN4Q56A73 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIN4Q56A73 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIN4Q56A73 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIN4Q56A73 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPIN4Q56A73 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIN4Q56A73 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIN4Q56A73 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIN4Q56A73 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIN4Q56A73 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIN4Q56A73 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIN4Q56A73 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIN4Q56A73 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIN4Q56A73 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIN4Q56A73 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIN4Q56A73 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIN4Q56A73 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIN4Q56A73 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIN4Q56A73 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIN4Q56A73 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIN4Q56A73 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIN4Q56A73 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIN4Q56A73 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIN4Q56A73 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIN4Q56A73 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPIN4Q56A73 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPIN4Q56A73 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIN4Q56A73 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIN4Q56A73 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIN4Q56A73 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIN4Q56A73 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIN4Q56A73 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPIN4Q56A73 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIN4Q56A73 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIN4Q56A73 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIN4Q56A73 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIN4Q56A73 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIN4Q56A73 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPIN4Q56A73 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPIN4Q56A73 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPIN4Q56A73 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPIN4Q56A73 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPIN4Q56A73 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPIN4Q56A73 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPIN4Q56A73 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPIN4Q56A73 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPIN4Q56A73 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPIN4Q56A73 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPIN4Q56A73 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPIN4Q56A73 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SPIN4Q56A73 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPIN4Q56A73 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPIN4Q56A73 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPIN4Q56A73 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPIN4Q56A73 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPIN4Q56A73 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPIN4Q56A73 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPIN4Q56A73 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPIN4Q56A73 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPIN4Q56A73 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPIN4Q56A73 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPIN4Q56A73 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPIN4Q56A73 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPIN4Q56A73 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPIN4Q56A73 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPIN4Q56A73 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SPIN4Q56A73 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPIN4Q56A73 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPIN4Q56A73 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPIN4Q56A73 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPIN4Q56A73 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPIN4Q56A73 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPIN4Q56A73 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPIN4Q56A73 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPIN4Q56A73 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPIN4Q56A73 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPIN4Q56A73 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIN4Q56A73 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIN4Q56A73 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIN4Q56A73 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIN4Q56A73 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIN4Q56A73 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIN4Q56A73 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIN4Q56A73 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPIN4Q56A73 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPIN4Q56A73 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPIN4Q56A73 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPIN4Q56A73 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPIN4Q56A73 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPIN4Q56A73 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPIN4Q56A73 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SPIN4Q56A73 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SPIN4Q56A73 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPIN4Q56A73 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 290 ms