Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf46Q504U0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf46Q504U0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf46Q504U0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C4orf46Q504U0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf46Q504U0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf46Q504U0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C4orf46Q504U0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4orf46Q504U0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4orf46Q504U0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4orf46Q504U0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C4orf46Q504U0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf46Q504U0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C4orf46Q504U0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf46Q504U0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C4orf46Q504U0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C4orf46Q504U0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4orf46Q504U0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4orf46Q504U0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf46Q504U0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf46Q504U0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf46Q504U0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf46Q504U0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf46Q504U0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4orf46Q504U0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf46Q504U0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf46Q504U0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C4orf46Q504U0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf46Q504U0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf46Q504U0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C4orf46Q504U0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4orf46Q504U0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4orf46Q504U0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4orf46Q504U0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4orf46Q504U0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C4orf46Q504U0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf46Q504U0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf46Q504U0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf46Q504U0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf46Q504U0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf46Q504U0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C4orf46Q504U0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf46Q504U0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf46Q504U0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf46Q504U0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C4orf46Q504U0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf46Q504U0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf46Q504U0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C4orf46Q504U0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4orf46Q504U0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4orf46Q504U0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C4orf46Q504U0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf46Q504U0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf46Q504U0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf46Q504U0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf46Q504U0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf46Q504U0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C4orf46Q504U0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf46Q504U0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C4orf46Q504U0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4orf46Q504U0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4orf46Q504U0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4orf46Q504U0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4orf46Q504U0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C4orf46Q504U0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf46Q504U0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf46Q504U0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf46Q504U0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf46Q504U0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C4orf46Q504U0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf46Q504U0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf46Q504U0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf46Q504U0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C4orf46Q504U0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C4orf46Q504U0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf46Q504U0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4orf46Q504U0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms