Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ZNF827Q17R98 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ZNF827Q17R98 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ZNF827Q17R98 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ZNF827Q17R98 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ZNF827Q17R98 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ZNF827Q17R98 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ZNF827Q17R98 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ZNF827Q17R98 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ZNF827Q17R98 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
ZNF827Q17R98 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ZNF827Q17R98 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
ZNF827Q17R98 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ZNF827Q17R98 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ZNF827Q17R98 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ZNF827Q17R98 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ZNF827Q17R98 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ZNF827Q17R98 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ZNF827Q17R98 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZNF827Q17R98 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZNF827Q17R98 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZNF827Q17R98 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZNF827Q17R98 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ZNF827Q17R98 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF827Q17R98 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ZNF827Q17R98 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
ZNF827Q17R98 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZNF827Q17R98 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF827Q17R98 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF827Q17R98 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ZNF827Q17R98 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ZNF827Q17R98 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF827Q17R98 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZNF827Q17R98 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZNF827Q17R98 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZNF827Q17R98 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZNF827Q17R98 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZNF827Q17R98 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZNF827Q17R98 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZNF827Q17R98 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZNF827Q17R98 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZNF827Q17R98 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ZNF827Q17R98 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF827Q17R98 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF827Q17R98 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF827Q17R98 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ZNF827Q17R98 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ZNF827Q17R98 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF827Q17R98 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF827Q17R98 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF827Q17R98 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF827Q17R98 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF827Q17R98 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
ZNF827Q17R98 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF827Q17R98 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF827Q17R98 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF827Q17R98 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF827Q17R98 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ZNF827Q17R98 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ZNF827Q17R98 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ZNF827Q17R98 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF827Q17R98 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF827Q17R98 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF827Q17R98 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZNF827Q17R98 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZNF827Q17R98 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZNF827Q17R98 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ZNF827Q17R98 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
ZNF827Q17R98 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZNF827Q17R98 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZNF827Q17R98 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZNF827Q17R98 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF827Q17R98 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZNF827Q17R98 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZNF827Q17R98 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF827Q17R98 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF827Q17R98 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF827Q17R98 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF827Q17R98 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZNF827Q17R98 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZNF827Q17R98 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZNF827Q17R98 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZNF827Q17R98 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZNF827Q17R98 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZNF827Q17R98 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZNF827Q17R98 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZNF827Q17R98 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
ZNF827Q17R98 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZNF827Q17R98 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZNF827Q17R98 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZNF827Q17R98 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
ZNF827Q17R98 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ZNF827Q17R98 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ZNF827Q17R98 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ZNF827Q17R98 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
ZNF827Q17R98 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ZNF827Q17R98 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ZNF827Q17R98 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZNF827Q17R98 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZNF827Q17R98 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms