Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
LAMA3Q16787 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMA3Q16787 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMA3Q16787 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMA3Q16787 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMA3Q16787 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMA3Q16787 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMA3Q16787 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMA3Q16787 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMA3Q16787 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMA3Q16787 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMA3Q16787 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMA3Q16787 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LAMA3Q16787 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMA3Q16787 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMA3Q16787 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMA3Q16787 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMA3Q16787 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMA3Q16787 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMA3Q16787 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMA3Q16787 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMA3Q16787 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMA3Q16787 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMA3Q16787 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMA3Q16787 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMA3Q16787 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMA3Q16787 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMA3Q16787 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMA3Q16787 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMA3Q16787 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMA3Q16787 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMA3Q16787 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMA3Q16787 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMA3Q16787 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMA3Q16787 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMA3Q16787 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMA3Q16787 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMA3Q16787 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMA3Q16787 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMA3Q16787 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMA3Q16787 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMA3Q16787 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMA3Q16787 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMA3Q16787 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMA3Q16787 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMA3Q16787 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMA3Q16787 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMA3Q16787 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMA3Q16787 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMA3Q16787 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMA3Q16787 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMA3Q16787 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMA3Q16787 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMA3Q16787 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
LAMA3Q16787 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMA3Q16787 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMA3Q16787 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LAMA3Q16787 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LAMA3Q16787 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LAMA3Q16787 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMA3Q16787 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMA3Q16787 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMA3Q16787 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMA3Q16787 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMA3Q16787 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMA3Q16787 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMA3Q16787 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMA3Q16787 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMA3Q16787 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMA3Q16787 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMA3Q16787 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMA3Q16787 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMA3Q16787 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMA3Q16787 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMA3Q16787 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMA3Q16787 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMA3Q16787 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMA3Q16787 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMA3Q16787 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMA3Q16787 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LAMA3Q16787 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMA3Q16787 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMA3Q16787 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMA3Q16787 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMA3Q16787 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMA3Q16787 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMA3Q16787 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMA3Q16787 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMA3Q16787 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMA3Q16787 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMA3Q16787 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMA3Q16787 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMA3Q16787 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMA3Q16787 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMA3Q16787 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMA3Q16787 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMA3Q16787 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMA3Q16787 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LAMA3Q16787 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LAMA3Q16787 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
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