Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PTPRKQ15262 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PTPRKQ15262 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
PTPRKQ15262 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
PTPRKQ15262 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
PTPRKQ15262 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
PTPRKQ15262 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
PTPRKQ15262 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
PTPRKQ15262 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PTPRKQ15262 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
PTPRKQ15262 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
PTPRKQ15262 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
PTPRKQ15262 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
PTPRKQ15262 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PTPRKQ15262 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
PTPRKQ15262 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PTPRKQ15262 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PTPRKQ15262 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
PTPRKQ15262 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
PTPRKQ15262 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PTPRKQ15262 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
PTPRKQ15262 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
PTPRKQ15262 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
PTPRKQ15262 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC40.03■■■■■ 4
PTPRKQ15262 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC40.03■■■■■ 4
PTPRKQ15262 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC40.03■■■■■ 4
PTPRKQ15262 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
PTPRKQ15262 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■■ 4
PTPRKQ15262 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
PTPRKQ15262 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
PTPRKQ15262 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
PTPRKQ15262 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
PTPRKQ15262 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
PTPRKQ15262 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
PTPRKQ15262 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC40■■■■□ 3.99
PTPRKQ15262 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
PTPRKQ15262 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC40■■■■□ 3.99
PTPRKQ15262 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
PTPRKQ15262 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
PTPRKQ15262 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PTPRKQ15262 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
PTPRKQ15262 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
PTPRKQ15262 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
PTPRKQ15262 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC39.94■■■■□ 3.98
PTPRKQ15262 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PTPRKQ15262 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PTPRKQ15262 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
PTPRKQ15262 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
PTPRKQ15262 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC39.9■■■■□ 3.98
PTPRKQ15262 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
PTPRKQ15262 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
PTPRKQ15262 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PTPRKQ15262 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PTPRKQ15262 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PTPRKQ15262 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
PTPRKQ15262 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
PTPRKQ15262 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
PTPRKQ15262 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
PTPRKQ15262 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
PTPRKQ15262 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
PTPRKQ15262 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
PTPRKQ15262 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
PTPRKQ15262 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
PTPRKQ15262 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
PTPRKQ15262 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PTPRKQ15262 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
PTPRKQ15262 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
PTPRKQ15262 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
PTPRKQ15262 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
PTPRKQ15262 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
PTPRKQ15262 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
PTPRKQ15262 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PTPRKQ15262 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
PTPRKQ15262 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
PTPRKQ15262 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
PTPRKQ15262 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PTPRKQ15262 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms