Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX39BQ13838 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX39BQ13838 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX39BQ13838 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX39BQ13838 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX39BQ13838 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX39BQ13838 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX39BQ13838 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX39BQ13838 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX39BQ13838 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX39BQ13838 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX39BQ13838 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX39BQ13838 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX39BQ13838 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX39BQ13838 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX39BQ13838 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX39BQ13838 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX39BQ13838 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX39BQ13838 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX39BQ13838 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX39BQ13838 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX39BQ13838 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX39BQ13838 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX39BQ13838 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX39BQ13838 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX39BQ13838 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX39BQ13838 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX39BQ13838 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX39BQ13838 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX39BQ13838 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX39BQ13838 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX39BQ13838 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX39BQ13838 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX39BQ13838 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX39BQ13838 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX39BQ13838 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX39BQ13838 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX39BQ13838 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX39BQ13838 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX39BQ13838 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX39BQ13838 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX39BQ13838 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX39BQ13838 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX39BQ13838 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX39BQ13838 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX39BQ13838 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX39BQ13838 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX39BQ13838 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX39BQ13838 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX39BQ13838 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX39BQ13838 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX39BQ13838 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX39BQ13838 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX39BQ13838 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX39BQ13838 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX39BQ13838 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX39BQ13838 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX39BQ13838 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX39BQ13838 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX39BQ13838 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX39BQ13838 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX39BQ13838 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX39BQ13838 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX39BQ13838 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX39BQ13838 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX39BQ13838 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX39BQ13838 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX39BQ13838 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX39BQ13838 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX39BQ13838 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX39BQ13838 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX39BQ13838 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX39BQ13838 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX39BQ13838 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX39BQ13838 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX39BQ13838 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX39BQ13838 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX39BQ13838 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX39BQ13838 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX39BQ13838 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX39BQ13838 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX39BQ13838 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX39BQ13838 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX39BQ13838 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX39BQ13838 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX39BQ13838 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX39BQ13838 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX39BQ13838 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX39BQ13838 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX39BQ13838 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX39BQ13838 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX39BQ13838 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX39BQ13838 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX39BQ13838 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX39BQ13838 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX39BQ13838 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX39BQ13838 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX39BQ13838 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX39BQ13838 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX39BQ13838 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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