Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS2P3Q13401 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS2P3Q13401 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS2P3Q13401 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS2P3Q13401 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS2P3Q13401 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS2P3Q13401 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMS2P3Q13401 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PMS2P3Q13401 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PMS2P3Q13401 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PMS2P3Q13401 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P3Q13401 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P3Q13401 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P3Q13401 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P3Q13401 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMS2P3Q13401 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS2P3Q13401 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMS2P3Q13401 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMS2P3Q13401 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMS2P3Q13401 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMS2P3Q13401 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS2P3Q13401 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMS2P3Q13401 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS2P3Q13401 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS2P3Q13401 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS2P3Q13401 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMS2P3Q13401 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMS2P3Q13401 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMS2P3Q13401 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PMS2P3Q13401 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS2P3Q13401 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMS2P3Q13401 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMS2P3Q13401 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PMS2P3Q13401 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMS2P3Q13401 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMS2P3Q13401 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMS2P3Q13401 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS2P3Q13401 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PMS2P3Q13401 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PMS2P3Q13401 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS2P3Q13401 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS2P3Q13401 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS2P3Q13401 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS2P3Q13401 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS2P3Q13401 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS2P3Q13401 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS2P3Q13401 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS2P3Q13401 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMS2P3Q13401 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMS2P3Q13401 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS2P3Q13401 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS2P3Q13401 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS2P3Q13401 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS2P3Q13401 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS2P3Q13401 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMS2P3Q13401 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMS2P3Q13401 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMS2P3Q13401 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PMS2P3Q13401 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PMS2P3Q13401 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
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