Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIGQ13278 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIGQ13278 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIGQ13278 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIGQ13278 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIGQ13278 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIGQ13278 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIGQ13278 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RIGQ13278 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIGQ13278 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIGQ13278 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIGQ13278 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIGQ13278 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIGQ13278 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIGQ13278 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIGQ13278 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIGQ13278 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIGQ13278 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIGQ13278 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIGQ13278 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIGQ13278 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIGQ13278 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIGQ13278 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIGQ13278 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIGQ13278 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIGQ13278 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIGQ13278 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIGQ13278 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIGQ13278 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIGQ13278 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIGQ13278 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RIGQ13278 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIGQ13278 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RIGQ13278 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RIGQ13278 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RIGQ13278 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RIGQ13278 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RIGQ13278 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RIGQ13278 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RIGQ13278 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RIGQ13278 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RIGQ13278 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RIGQ13278 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RIGQ13278 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RIGQ13278 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RIGQ13278 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RIGQ13278 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RIGQ13278 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RIGQ13278 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RIGQ13278 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RIGQ13278 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RIGQ13278 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RIGQ13278 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RIGQ13278 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RIGQ13278 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RIGQ13278 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RIGQ13278 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RIGQ13278 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RIGQ13278 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RIGQ13278 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RIGQ13278 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RIGQ13278 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RIGQ13278 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RIGQ13278 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RIGQ13278 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RIGQ13278 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RIGQ13278 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RIGQ13278 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RIGQ13278 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RIGQ13278 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIGQ13278 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RIGQ13278 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIGQ13278 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIGQ13278 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIGQ13278 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIGQ13278 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RIGQ13278 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIGQ13278 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RIGQ13278 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIGQ13278 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIGQ13278 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIGQ13278 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIGQ13278 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIGQ13278 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIGQ13278 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RIGQ13278 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RIGQ13278 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIGQ13278 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIGQ13278 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RIGQ13278 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIGQ13278 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIGQ13278 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIGQ13278 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIGQ13278 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIGQ13278 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIGQ13278 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIGQ13278 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIGQ13278 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIGQ13278 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIGQ13278 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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