Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAPQ12770 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAPQ12770 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAPQ12770 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SCAPQ12770 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCAPQ12770 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAPQ12770 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAPQ12770 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCAPQ12770 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPQ12770 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPQ12770 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPQ12770 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPQ12770 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPQ12770 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCAPQ12770 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCAPQ12770 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPQ12770 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPQ12770 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCAPQ12770 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAPQ12770 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAPQ12770 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAPQ12770 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAPQ12770 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCAPQ12770 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCAPQ12770 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SCAPQ12770 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAPQ12770 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAPQ12770 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCAPQ12770 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCAPQ12770 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPQ12770 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPQ12770 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCAPQ12770 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPQ12770 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPQ12770 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAPQ12770 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAPQ12770 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAPQ12770 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAPQ12770 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCAPQ12770 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAPQ12770 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAPQ12770 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAPQ12770 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAPQ12770 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAPQ12770 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAPQ12770 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAPQ12770 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAPQ12770 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAPQ12770 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAPQ12770 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPQ12770 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPQ12770 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPQ12770 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAPQ12770 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAPQ12770 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCAPQ12770 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCAPQ12770 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCAPQ12770 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCAPQ12770 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCAPQ12770 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAPQ12770 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCAPQ12770 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPQ12770 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPQ12770 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPQ12770 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPQ12770 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPQ12770 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCAPQ12770 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCAPQ12770 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAPQ12770 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAPQ12770 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAPQ12770 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAPQ12770 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAPQ12770 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCAPQ12770 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAPQ12770 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAPQ12770 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAPQ12770 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCAPQ12770 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPQ12770 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPQ12770 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCAPQ12770 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAPQ12770 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SCAPQ12770 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAPQ12770 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAPQ12770 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAPQ12770 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAPQ12770 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCAPQ12770 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAPQ12770 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAPQ12770 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAPQ12770 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAPQ12770 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCAPQ12770 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAPQ12770 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCAPQ12770 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAPQ12770 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCAPQ12770 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAPQ12770 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCAPQ12770 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms