Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAV1Q03135 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAV1Q03135 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAV1Q03135 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAV1Q03135 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAV1Q03135 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAV1Q03135 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAV1Q03135 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAV1Q03135 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CAV1Q03135 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAV1Q03135 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAV1Q03135 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAV1Q03135 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAV1Q03135 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAV1Q03135 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAV1Q03135 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAV1Q03135 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAV1Q03135 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAV1Q03135 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAV1Q03135 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAV1Q03135 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAV1Q03135 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAV1Q03135 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAV1Q03135 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAV1Q03135 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAV1Q03135 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAV1Q03135 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAV1Q03135 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAV1Q03135 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAV1Q03135 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAV1Q03135 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAV1Q03135 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAV1Q03135 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAV1Q03135 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAV1Q03135 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAV1Q03135 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAV1Q03135 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CAV1Q03135 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CAV1Q03135 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAV1Q03135 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CAV1Q03135 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CAV1Q03135 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAV1Q03135 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAV1Q03135 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAV1Q03135 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAV1Q03135 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAV1Q03135 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAV1Q03135 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAV1Q03135 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAV1Q03135 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAV1Q03135 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CAV1Q03135 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CAV1Q03135 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAV1Q03135 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAV1Q03135 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAV1Q03135 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAV1Q03135 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAV1Q03135 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAV1Q03135 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAV1Q03135 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAV1Q03135 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAV1Q03135 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAV1Q03135 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAV1Q03135 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAV1Q03135 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAV1Q03135 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAV1Q03135 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAV1Q03135 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CAV1Q03135 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAV1Q03135 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAV1Q03135 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAV1Q03135 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms