Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF8Q02556 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF8Q02556 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF8Q02556 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF8Q02556 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF8Q02556 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF8Q02556 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRF8Q02556 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRF8Q02556 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF8Q02556 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRF8Q02556 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IRF8Q02556 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IRF8Q02556 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRF8Q02556 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF8Q02556 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF8Q02556 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF8Q02556 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRF8Q02556 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF8Q02556 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF8Q02556 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF8Q02556 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRF8Q02556 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF8Q02556 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF8Q02556 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF8Q02556 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF8Q02556 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF8Q02556 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRF8Q02556 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF8Q02556 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF8Q02556 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF8Q02556 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRF8Q02556 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF8Q02556 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRF8Q02556 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IRF8Q02556 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF8Q02556 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF8Q02556 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF8Q02556 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF8Q02556 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IRF8Q02556 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF8Q02556 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF8Q02556 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF8Q02556 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IRF8Q02556 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRF8Q02556 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRF8Q02556 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IRF8Q02556 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF8Q02556 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IRF8Q02556 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF8Q02556 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF8Q02556 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
IRF8Q02556 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF8Q02556 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF8Q02556 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF8Q02556 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF8Q02556 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF8Q02556 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF8Q02556 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF8Q02556 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF8Q02556 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF8Q02556 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF8Q02556 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF8Q02556 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF8Q02556 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF8Q02556 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF8Q02556 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF8Q02556 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF8Q02556 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF8Q02556 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRF8Q02556 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRF8Q02556 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRF8Q02556 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF8Q02556 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF8Q02556 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF8Q02556 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms