Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHDQ02161 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHDQ02161 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHDQ02161 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHDQ02161 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RHDQ02161 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHDQ02161 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHDQ02161 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHDQ02161 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHDQ02161 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHDQ02161 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHDQ02161 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHDQ02161 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHDQ02161 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHDQ02161 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHDQ02161 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHDQ02161 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHDQ02161 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHDQ02161 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHDQ02161 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHDQ02161 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHDQ02161 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RHDQ02161 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHDQ02161 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHDQ02161 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHDQ02161 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHDQ02161 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHDQ02161 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHDQ02161 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHDQ02161 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHDQ02161 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHDQ02161 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHDQ02161 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RHDQ02161 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHDQ02161 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHDQ02161 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHDQ02161 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHDQ02161 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHDQ02161 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHDQ02161 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHDQ02161 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHDQ02161 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHDQ02161 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHDQ02161 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHDQ02161 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHDQ02161 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHDQ02161 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHDQ02161 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RHDQ02161 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHDQ02161 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHDQ02161 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHDQ02161 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHDQ02161 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHDQ02161 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHDQ02161 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHDQ02161 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RHDQ02161 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RHDQ02161 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHDQ02161 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHDQ02161 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHDQ02161 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHDQ02161 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHDQ02161 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHDQ02161 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHDQ02161 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHDQ02161 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHDQ02161 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHDQ02161 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHDQ02161 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHDQ02161 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHDQ02161 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHDQ02161 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHDQ02161 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHDQ02161 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHDQ02161 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHDQ02161 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHDQ02161 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHDQ02161 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHDQ02161 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHDQ02161 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHDQ02161 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHDQ02161 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHDQ02161 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHDQ02161 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHDQ02161 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHDQ02161 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHDQ02161 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHDQ02161 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHDQ02161 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHDQ02161 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHDQ02161 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHDQ02161 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RHDQ02161 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RHDQ02161 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RHDQ02161 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHDQ02161 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHDQ02161 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHDQ02161 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHDQ02161 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RHDQ02161 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms