Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPIBQ01892 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPIBQ01892 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPIBQ01892 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPIBQ01892 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPIBQ01892 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPIBQ01892 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPIBQ01892 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIBQ01892 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIBQ01892 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPIBQ01892 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIBQ01892 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIBQ01892 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIBQ01892 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIBQ01892 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPIBQ01892 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPIBQ01892 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPIBQ01892 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIBQ01892 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIBQ01892 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPIBQ01892 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPIBQ01892 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPIBQ01892 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIBQ01892 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIBQ01892 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIBQ01892 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIBQ01892 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPIBQ01892 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPIBQ01892 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPIBQ01892 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIBQ01892 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIBQ01892 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIBQ01892 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIBQ01892 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIBQ01892 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIBQ01892 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIBQ01892 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIBQ01892 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIBQ01892 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIBQ01892 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIBQ01892 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIBQ01892 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIBQ01892 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIBQ01892 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIBQ01892 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIBQ01892 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIBQ01892 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIBQ01892 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIBQ01892 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIBQ01892 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIBQ01892 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIBQ01892 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIBQ01892 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPIBQ01892 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPIBQ01892 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIBQ01892 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIBQ01892 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIBQ01892 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIBQ01892 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPIBQ01892 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPIBQ01892 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPIBQ01892 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIBQ01892 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPIBQ01892 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPIBQ01892 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPIBQ01892 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIBQ01892 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIBQ01892 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIBQ01892 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIBQ01892 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPIBQ01892 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIBQ01892 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIBQ01892 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIBQ01892 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIBQ01892 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIBQ01892 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIBQ01892 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPIBQ01892 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPIBQ01892 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPIBQ01892 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIBQ01892 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIBQ01892 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIBQ01892 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIBQ01892 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIBQ01892 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIBQ01892 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIBQ01892 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPIBQ01892 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIBQ01892 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPIBQ01892 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SPIBQ01892 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIBQ01892 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIBQ01892 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIBQ01892 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIBQ01892 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIBQ01892 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIBQ01892 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIBQ01892 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIBQ01892 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIBQ01892 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms