Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MYBPC1Q00872 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYBPC1Q00872 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYBPC1Q00872 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYBPC1Q00872 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYBPC1Q00872 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYBPC1Q00872 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYBPC1Q00872 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYBPC1Q00872 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYBPC1Q00872 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYBPC1Q00872 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYBPC1Q00872 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYBPC1Q00872 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYBPC1Q00872 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYBPC1Q00872 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYBPC1Q00872 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYBPC1Q00872 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYBPC1Q00872 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYBPC1Q00872 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYBPC1Q00872 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYBPC1Q00872 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYBPC1Q00872 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYBPC1Q00872 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYBPC1Q00872 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYBPC1Q00872 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYBPC1Q00872 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYBPC1Q00872 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYBPC1Q00872 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYBPC1Q00872 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYBPC1Q00872 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYBPC1Q00872 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYBPC1Q00872 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYBPC1Q00872 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYBPC1Q00872 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYBPC1Q00872 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYBPC1Q00872 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYBPC1Q00872 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYBPC1Q00872 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYBPC1Q00872 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYBPC1Q00872 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYBPC1Q00872 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYBPC1Q00872 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYBPC1Q00872 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MYBPC1Q00872 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MYBPC1Q00872 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MYBPC1Q00872 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYBPC1Q00872 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYBPC1Q00872 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYBPC1Q00872 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYBPC1Q00872 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYBPC1Q00872 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYBPC1Q00872 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYBPC1Q00872 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYBPC1Q00872 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MYBPC1Q00872 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYBPC1Q00872 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYBPC1Q00872 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYBPC1Q00872 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYBPC1Q00872 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYBPC1Q00872 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYBPC1Q00872 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYBPC1Q00872 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYBPC1Q00872 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYBPC1Q00872 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYBPC1Q00872 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYBPC1Q00872 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYBPC1Q00872 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYBPC1Q00872 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYBPC1Q00872 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYBPC1Q00872 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYBPC1Q00872 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYBPC1Q00872 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYBPC1Q00872 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYBPC1Q00872 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYBPC1Q00872 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYBPC1Q00872 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYBPC1Q00872 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYBPC1Q00872 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYBPC1Q00872 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYBPC1Q00872 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MYBPC1Q00872 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYBPC1Q00872 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYBPC1Q00872 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYBPC1Q00872 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYBPC1Q00872 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYBPC1Q00872 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYBPC1Q00872 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYBPC1Q00872 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYBPC1Q00872 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYBPC1Q00872 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYBPC1Q00872 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYBPC1Q00872 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MYBPC1Q00872 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYBPC1Q00872 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYBPC1Q00872 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYBPC1Q00872 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYBPC1Q00872 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYBPC1Q00872 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYBPC1Q00872 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYBPC1Q00872 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms