Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIM1P81133 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIM1P81133 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIM1P81133 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIM1P81133 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIM1P81133 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIM1P81133 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIM1P81133 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIM1P81133 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIM1P81133 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIM1P81133 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIM1P81133 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIM1P81133 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIM1P81133 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SIM1P81133 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SIM1P81133 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SIM1P81133 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SIM1P81133 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SIM1P81133 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SIM1P81133 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SIM1P81133 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SIM1P81133 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SIM1P81133 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIM1P81133 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIM1P81133 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIM1P81133 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIM1P81133 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIM1P81133 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIM1P81133 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIM1P81133 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIM1P81133 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIM1P81133 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SIM1P81133 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIM1P81133 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIM1P81133 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIM1P81133 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIM1P81133 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIM1P81133 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIM1P81133 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SIM1P81133 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIM1P81133 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIM1P81133 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIM1P81133 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIM1P81133 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIM1P81133 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIM1P81133 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIM1P81133 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIM1P81133 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SIM1P81133 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIM1P81133 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIM1P81133 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIM1P81133 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIM1P81133 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIM1P81133 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIM1P81133 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIM1P81133 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIM1P81133 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIM1P81133 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIM1P81133 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIM1P81133 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIM1P81133 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIM1P81133 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIM1P81133 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIM1P81133 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIM1P81133 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIM1P81133 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIM1P81133 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIM1P81133 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIM1P81133 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIM1P81133 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIM1P81133 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIM1P81133 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIM1P81133 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIM1P81133 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIM1P81133 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIM1P81133 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIM1P81133 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIM1P81133 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIM1P81133 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIM1P81133 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIM1P81133 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIM1P81133 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIM1P81133 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIM1P81133 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SIM1P81133 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIM1P81133 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIM1P81133 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIM1P81133 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIM1P81133 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIM1P81133 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIM1P81133 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIM1P81133 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIM1P81133 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIM1P81133 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIM1P81133 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SIM1P81133 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIM1P81133 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIM1P81133 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIM1P81133 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIM1P81133 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms