Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RELNP78509 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RELNP78509 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RELNP78509 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RELNP78509 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RELNP78509 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RELNP78509 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RELNP78509 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RELNP78509 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RELNP78509 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RELNP78509 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RELNP78509 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RELNP78509 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RELNP78509 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RELNP78509 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RELNP78509 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RELNP78509 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RELNP78509 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RELNP78509 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RELNP78509 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RELNP78509 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RELNP78509 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RELNP78509 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RELNP78509 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RELNP78509 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RELNP78509 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RELNP78509 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RELNP78509 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RELNP78509 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RELNP78509 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RELNP78509 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RELNP78509 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RELNP78509 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RELNP78509 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RELNP78509 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RELNP78509 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RELNP78509 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RELNP78509 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RELNP78509 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RELNP78509 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RELNP78509 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RELNP78509 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RELNP78509 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RELNP78509 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RELNP78509 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RELNP78509 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RELNP78509 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RELNP78509 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RELNP78509 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RELNP78509 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RELNP78509 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RELNP78509 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RELNP78509 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RELNP78509 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RELNP78509 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RELNP78509 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RELNP78509 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RELNP78509 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RELNP78509 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RELNP78509 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RELNP78509 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RELNP78509 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RELNP78509 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RELNP78509 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RELNP78509 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RELNP78509 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RELNP78509 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RELNP78509 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RELNP78509 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RELNP78509 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RELNP78509 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RELNP78509 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RELNP78509 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RELNP78509 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RELNP78509 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RELNP78509 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RELNP78509 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RELNP78509 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RELNP78509 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RELNP78509 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RELNP78509 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RELNP78509 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RELNP78509 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RELNP78509 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RELNP78509 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RELNP78509 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RELNP78509 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RELNP78509 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RELNP78509 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RELNP78509 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RELNP78509 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RELNP78509 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RELNP78509 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RELNP78509 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RELNP78509 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RELNP78509 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RELNP78509 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RELNP78509 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RELNP78509 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RELNP78509 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms