Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
IRX6P78412 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
IRX6P78412 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
IRX6P78412 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
IRX6P78412 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
IRX6P78412 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
IRX6P78412 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
IRX6P78412 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
IRX6P78412 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
IRX6P78412 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
IRX6P78412 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
IRX6P78412 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
IRX6P78412 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
IRX6P78412 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
IRX6P78412 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
IRX6P78412 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
IRX6P78412 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
IRX6P78412 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
IRX6P78412 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
IRX6P78412 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
IRX6P78412 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
IRX6P78412 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
IRX6P78412 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
IRX6P78412 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
IRX6P78412 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
IRX6P78412 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
IRX6P78412 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
IRX6P78412 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
IRX6P78412 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
IRX6P78412 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
IRX6P78412 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
IRX6P78412 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
IRX6P78412 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
IRX6P78412 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
IRX6P78412 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
IRX6P78412 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
IRX6P78412 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
IRX6P78412 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
IRX6P78412 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
IRX6P78412 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
IRX6P78412 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
IRX6P78412 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
IRX6P78412 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
IRX6P78412 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
IRX6P78412 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
IRX6P78412 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
IRX6P78412 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
IRX6P78412 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
IRX6P78412 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
IRX6P78412 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
IRX6P78412 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
IRX6P78412 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
IRX6P78412 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
IRX6P78412 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
IRX6P78412 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
IRX6P78412 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
IRX6P78412 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
IRX6P78412 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
IRX6P78412 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
IRX6P78412 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
IRX6P78412 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
IRX6P78412 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
IRX6P78412 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
IRX6P78412 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
IRX6P78412 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
IRX6P78412 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
IRX6P78412 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
IRX6P78412 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
IRX6P78412 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
IRX6P78412 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
IRX6P78412 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
IRX6P78412 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
IRX6P78412 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
IRX6P78412 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
IRX6P78412 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
IRX6P78412 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
IRX6P78412 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
IRX6P78412 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
IRX6P78412 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
IRX6P78412 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
IRX6P78412 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
IRX6P78412 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
IRX6P78412 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
IRX6P78412 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
IRX6P78412 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
IRX6P78412 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
IRX6P78412 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
IRX6P78412 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
IRX6P78412 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
IRX6P78412 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
IRX6P78412 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
IRX6P78412 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
IRX6P78412 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
IRX6P78412 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
IRX6P78412 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
IRX6P78412 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
IRX6P78412 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
IRX6P78412 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
IRX6P78412 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
IRX6P78412 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms