Protein–RNA interactions for Protein: P62979

RPS27A, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27AP62979 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPS27AP62979 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS27AP62979 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS27AP62979 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS27AP62979 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS27AP62979 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS27AP62979 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS27AP62979 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS27AP62979 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS27AP62979 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS27AP62979 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS27AP62979 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS27AP62979 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS27AP62979 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS27AP62979 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS27AP62979 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS27AP62979 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS27AP62979 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS27AP62979 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS27AP62979 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPS27AP62979 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS27AP62979 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS27AP62979 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS27AP62979 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS27AP62979 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS27AP62979 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS27AP62979 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS27AP62979 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS27AP62979 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS27AP62979 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS27AP62979 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPS27AP62979 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS27AP62979 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS27AP62979 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS27AP62979 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS27AP62979 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS27AP62979 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS27AP62979 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS27AP62979 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS27AP62979 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS27AP62979 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS27AP62979 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms