Protein–RNA interactions for Protein: P57103

SLC8A3, Sodium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A3P57103 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC8A3P57103 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC8A3P57103 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC8A3P57103 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC8A3P57103 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC8A3P57103 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC8A3P57103 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC8A3P57103 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC8A3P57103 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC8A3P57103 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC8A3P57103 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC8A3P57103 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC8A3P57103 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC8A3P57103 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC8A3P57103 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC8A3P57103 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC8A3P57103 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC8A3P57103 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC8A3P57103 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC8A3P57103 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC8A3P57103 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC8A3P57103 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC8A3P57103 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC8A3P57103 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC8A3P57103 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC8A3P57103 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC8A3P57103 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC8A3P57103 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC8A3P57103 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC8A3P57103 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC8A3P57103 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC8A3P57103 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC8A3P57103 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC8A3P57103 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC8A3P57103 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC8A3P57103 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC8A3P57103 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC8A3P57103 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC8A3P57103 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC8A3P57103 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC8A3P57103 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC8A3P57103 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC8A3P57103 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC8A3P57103 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC8A3P57103 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC8A3P57103 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC8A3P57103 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC8A3P57103 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC8A3P57103 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC8A3P57103 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC8A3P57103 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC8A3P57103 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC8A3P57103 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC8A3P57103 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC8A3P57103 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC8A3P57103 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC8A3P57103 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC8A3P57103 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC8A3P57103 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC8A3P57103 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC8A3P57103 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC8A3P57103 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC8A3P57103 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC8A3P57103 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC8A3P57103 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC8A3P57103 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC8A3P57103 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC8A3P57103 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC8A3P57103 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC8A3P57103 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC8A3P57103 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC8A3P57103 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC8A3P57103 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC8A3P57103 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC8A3P57103 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC8A3P57103 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC8A3P57103 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC8A3P57103 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC8A3P57103 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC8A3P57103 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC8A3P57103 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC8A3P57103 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC8A3P57103 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC8A3P57103 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC8A3P57103 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC8A3P57103 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC8A3P57103 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC8A3P57103 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC8A3P57103 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC8A3P57103 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC8A3P57103 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC8A3P57103 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC8A3P57103 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC8A3P57103 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC8A3P57103 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC8A3P57103 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC8A3P57103 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC8A3P57103 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC8A3P57103 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC8A3P57103 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms