Protein–RNA interactions for Protein: P56880

CLDN20, Claudin-20, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN20P56880 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN20P56880 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN20P56880 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLDN20P56880 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN20P56880 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN20P56880 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN20P56880 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN20P56880 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN20P56880 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN20P56880 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN20P56880 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN20P56880 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN20P56880 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN20P56880 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN20P56880 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN20P56880 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN20P56880 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN20P56880 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN20P56880 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN20P56880 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN20P56880 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN20P56880 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN20P56880 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN20P56880 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN20P56880 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLDN20P56880 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLDN20P56880 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN20P56880 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN20P56880 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN20P56880 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN20P56880 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN20P56880 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN20P56880 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN20P56880 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN20P56880 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN20P56880 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN20P56880 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN20P56880 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN20P56880 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN20P56880 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN20P56880 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN20P56880 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN20P56880 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN20P56880 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN20P56880 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN20P56880 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN20P56880 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN20P56880 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN20P56880 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN20P56880 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN20P56880 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN20P56880 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN20P56880 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN20P56880 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN20P56880 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN20P56880 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN20P56880 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN20P56880 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN20P56880 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN20P56880 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLDN20P56880 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN20P56880 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN20P56880 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN20P56880 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN20P56880 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN20P56880 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN20P56880 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN20P56880 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN20P56880 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN20P56880 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN20P56880 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN20P56880 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN20P56880 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN20P56880 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN20P56880 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms