Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN8P56748 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN8P56748 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN8P56748 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN8P56748 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN8P56748 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN8P56748 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN8P56748 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN8P56748 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN8P56748 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN8P56748 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN8P56748 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN8P56748 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN8P56748 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN8P56748 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN8P56748 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN8P56748 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN8P56748 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN8P56748 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN8P56748 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLDN8P56748 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLDN8P56748 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN8P56748 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN8P56748 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN8P56748 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN8P56748 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN8P56748 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN8P56748 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN8P56748 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN8P56748 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN8P56748 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN8P56748 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN8P56748 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN8P56748 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN8P56748 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN8P56748 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN8P56748 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN8P56748 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN8P56748 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN8P56748 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN8P56748 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN8P56748 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLDN8P56748 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN8P56748 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN8P56748 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN8P56748 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN8P56748 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN8P56748 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN8P56748 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN8P56748 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN8P56748 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN8P56748 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN8P56748 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN8P56748 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN8P56748 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN8P56748 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN8P56748 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN8P56748 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN8P56748 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN8P56748 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN8P56748 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN8P56748 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN8P56748 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN8P56748 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN8P56748 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN8P56748 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN8P56748 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN8P56748 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN8P56748 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN8P56748 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN8P56748 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN8P56748 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN8P56748 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN8P56748 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN8P56748 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN8P56748 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN8P56748 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN8P56748 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN8P56748 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN8P56748 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN8P56748 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN8P56748 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN8P56748 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN8P56748 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN8P56748 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN8P56748 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN8P56748 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN8P56748 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN8P56748 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN8P56748 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN8P56748 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN8P56748 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN8P56748 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN8P56748 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms