Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME5P56597 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME5P56597 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME5P56597 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME5P56597 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME5P56597 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME5P56597 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME5P56597 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME5P56597 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME5P56597 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME5P56597 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME5P56597 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NME5P56597 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME5P56597 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME5P56597 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME5P56597 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME5P56597 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NME5P56597 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME5P56597 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME5P56597 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME5P56597 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME5P56597 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NME5P56597 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME5P56597 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME5P56597 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME5P56597 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NME5P56597 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NME5P56597 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NME5P56597 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NME5P56597 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME5P56597 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME5P56597 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME5P56597 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME5P56597 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME5P56597 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NME5P56597 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NME5P56597 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME5P56597 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NME5P56597 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NME5P56597 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NME5P56597 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NME5P56597 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NME5P56597 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NME5P56597 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NME5P56597 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NME5P56597 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NME5P56597 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NME5P56597 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NME5P56597 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NME5P56597 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NME5P56597 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NME5P56597 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NME5P56597 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NME5P56597 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NME5P56597 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NME5P56597 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NME5P56597 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NME5P56597 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NME5P56597 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NME5P56597 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NME5P56597 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME5P56597 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME5P56597 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME5P56597 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME5P56597 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME5P56597 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NME5P56597 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME5P56597 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NME5P56597 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME5P56597 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME5P56597 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NME5P56597 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME5P56597 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME5P56597 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME5P56597 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME5P56597 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME5P56597 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NME5P56597 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NME5P56597 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NME5P56597 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME5P56597 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME5P56597 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME5P56597 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME5P56597 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NME5P56597 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME5P56597 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME5P56597 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME5P56597 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME5P56597 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NME5P56597 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME5P56597 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME5P56597 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NME5P56597 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME5P56597 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NME5P56597 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NME5P56597 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME5P56597 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME5P56597 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME5P56597 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME5P56597 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms