Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAV3P56539 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAV3P56539 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAV3P56539 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAV3P56539 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAV3P56539 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAV3P56539 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAV3P56539 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAV3P56539 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAV3P56539 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAV3P56539 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAV3P56539 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAV3P56539 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAV3P56539 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAV3P56539 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CAV3P56539 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAV3P56539 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAV3P56539 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAV3P56539 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAV3P56539 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAV3P56539 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAV3P56539 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAV3P56539 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAV3P56539 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAV3P56539 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CAV3P56539 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAV3P56539 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAV3P56539 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAV3P56539 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAV3P56539 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CAV3P56539 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAV3P56539 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAV3P56539 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAV3P56539 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAV3P56539 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAV3P56539 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAV3P56539 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAV3P56539 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CAV3P56539 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAV3P56539 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAV3P56539 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAV3P56539 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAV3P56539 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAV3P56539 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAV3P56539 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAV3P56539 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAV3P56539 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAV3P56539 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAV3P56539 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAV3P56539 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAV3P56539 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAV3P56539 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAV3P56539 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAV3P56539 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAV3P56539 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAV3P56539 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAV3P56539 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAV3P56539 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAV3P56539 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAV3P56539 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAV3P56539 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAV3P56539 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAV3P56539 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAV3P56539 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAV3P56539 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAV3P56539 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAV3P56539 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAV3P56539 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAV3P56539 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAV3P56539 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAV3P56539 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAV3P56539 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAV3P56539 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAV3P56539 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAV3P56539 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAV3P56539 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAV3P56539 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAV3P56539 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAV3P56539 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAV3P56539 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAV3P56539 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAV3P56539 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAV3P56539 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAV3P56539 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAV3P56539 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAV3P56539 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAV3P56539 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAV3P56539 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAV3P56539 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAV3P56539 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAV3P56539 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAV3P56539 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAV3P56539 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAV3P56539 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAV3P56539 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAV3P56539 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAV3P56539 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAV3P56539 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAV3P56539 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAV3P56539 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms