Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RRP1P56182 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RRP1P56182 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RRP1P56182 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RRP1P56182 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RRP1P56182 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RRP1P56182 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RRP1P56182 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RRP1P56182 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RRP1P56182 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RRP1P56182 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RRP1P56182 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RRP1P56182 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RRP1P56182 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RRP1P56182 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RRP1P56182 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RRP1P56182 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RRP1P56182 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RRP1P56182 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RRP1P56182 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RRP1P56182 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RRP1P56182 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RRP1P56182 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
RRP1P56182 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RRP1P56182 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RRP1P56182 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RRP1P56182 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RRP1P56182 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RRP1P56182 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RRP1P56182 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RRP1P56182 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RRP1P56182 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RRP1P56182 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
RRP1P56182 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
RRP1P56182 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RRP1P56182 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RRP1P56182 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RRP1P56182 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
RRP1P56182 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RRP1P56182 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RRP1P56182 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RRP1P56182 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
RRP1P56182 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RRP1P56182 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RRP1P56182 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RRP1P56182 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RRP1P56182 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RRP1P56182 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RRP1P56182 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RRP1P56182 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RRP1P56182 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RRP1P56182 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RRP1P56182 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RRP1P56182 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RRP1P56182 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RRP1P56182 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RRP1P56182 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RRP1P56182 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RRP1P56182 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RRP1P56182 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RRP1P56182 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RRP1P56182 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RRP1P56182 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RRP1P56182 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RRP1P56182 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
RRP1P56182 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
RRP1P56182 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRP1P56182 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRP1P56182 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRP1P56182 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RRP1P56182 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RRP1P56182 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RRP1P56182 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRP1P56182 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRP1P56182 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RRP1P56182 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RRP1P56182 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
RRP1P56182 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
RRP1P56182 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RRP1P56182 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RRP1P56182 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RRP1P56182 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RRP1P56182 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RRP1P56182 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RRP1P56182 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RRP1P56182 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RRP1P56182 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RRP1P56182 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RRP1P56182 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RRP1P56182 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RRP1P56182 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RRP1P56182 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RRP1P56182 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RRP1P56182 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RRP1P56182 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RRP1P56182 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RRP1P56182 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RRP1P56182 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RRP1P56182 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RRP1P56182 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms