Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMTNP53814 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMTNP53814 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMTNP53814 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMTNP53814 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMTNP53814 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMTNP53814 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMTNP53814 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SMTNP53814 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMTNP53814 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMTNP53814 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMTNP53814 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SMTNP53814 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMTNP53814 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMTNP53814 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMTNP53814 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMTNP53814 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMTNP53814 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMTNP53814 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMTNP53814 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMTNP53814 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMTNP53814 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SMTNP53814 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMTNP53814 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMTNP53814 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMTNP53814 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SMTNP53814 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMTNP53814 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMTNP53814 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMTNP53814 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMTNP53814 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMTNP53814 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMTNP53814 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SMTNP53814 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SMTNP53814 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMTNP53814 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMTNP53814 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMTNP53814 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMTNP53814 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMTNP53814 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMTNP53814 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMTNP53814 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMTNP53814 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMTNP53814 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMTNP53814 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMTNP53814 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMTNP53814 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMTNP53814 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SMTNP53814 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SMTNP53814 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMTNP53814 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMTNP53814 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMTNP53814 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMTNP53814 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMTNP53814 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMTNP53814 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMTNP53814 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMTNP53814 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMTNP53814 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMTNP53814 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMTNP53814 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SMTNP53814 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMTNP53814 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMTNP53814 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMTNP53814 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMTNP53814 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMTNP53814 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMTNP53814 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMTNP53814 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMTNP53814 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMTNP53814 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMTNP53814 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SMTNP53814 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMTNP53814 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMTNP53814 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMTNP53814 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMTNP53814 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMTNP53814 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMTNP53814 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMTNP53814 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMTNP53814 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMTNP53814 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMTNP53814 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMTNP53814 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMTNP53814 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMTNP53814 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMTNP53814 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMTNP53814 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMTNP53814 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMTNP53814 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMTNP53814 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SMTNP53814 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SMTNP53814 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMTNP53814 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMTNP53814 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMTNP53814 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMTNP53814 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMTNP53814 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMTNP53814 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMTNP53814 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms