Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LIMK1P53667 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LIMK1P53667 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LIMK1P53667 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LIMK1P53667 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LIMK1P53667 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LIMK1P53667 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LIMK1P53667 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LIMK1P53667 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LIMK1P53667 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LIMK1P53667 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LIMK1P53667 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LIMK1P53667 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LIMK1P53667 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LIMK1P53667 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LIMK1P53667 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LIMK1P53667 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LIMK1P53667 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LIMK1P53667 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LIMK1P53667 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LIMK1P53667 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LIMK1P53667 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LIMK1P53667 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LIMK1P53667 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LIMK1P53667 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LIMK1P53667 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LIMK1P53667 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LIMK1P53667 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LIMK1P53667 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LIMK1P53667 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LIMK1P53667 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LIMK1P53667 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LIMK1P53667 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LIMK1P53667 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LIMK1P53667 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LIMK1P53667 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LIMK1P53667 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LIMK1P53667 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LIMK1P53667 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LIMK1P53667 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LIMK1P53667 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LIMK1P53667 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LIMK1P53667 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LIMK1P53667 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LIMK1P53667 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LIMK1P53667 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LIMK1P53667 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LIMK1P53667 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LIMK1P53667 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LIMK1P53667 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LIMK1P53667 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LIMK1P53667 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIMK1P53667 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIMK1P53667 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIMK1P53667 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIMK1P53667 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIMK1P53667 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LIMK1P53667 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIMK1P53667 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LIMK1P53667 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIMK1P53667 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIMK1P53667 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIMK1P53667 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIMK1P53667 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIMK1P53667 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIMK1P53667 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIMK1P53667 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIMK1P53667 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIMK1P53667 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIMK1P53667 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIMK1P53667 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIMK1P53667 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIMK1P53667 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIMK1P53667 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIMK1P53667 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIMK1P53667 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIMK1P53667 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms