Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PLXNA3P51805 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PLXNA3P51805 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PLXNA3P51805 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLXNA3P51805 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLXNA3P51805 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLXNA3P51805 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLXNA3P51805 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLXNA3P51805 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLXNA3P51805 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PLXNA3P51805 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLXNA3P51805 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLXNA3P51805 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLXNA3P51805 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLXNA3P51805 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLXNA3P51805 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLXNA3P51805 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLXNA3P51805 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLXNA3P51805 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLXNA3P51805 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLXNA3P51805 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLXNA3P51805 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLXNA3P51805 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNA3P51805 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNA3P51805 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNA3P51805 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNA3P51805 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNA3P51805 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLXNA3P51805 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXNA3P51805 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLXNA3P51805 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNA3P51805 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNA3P51805 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNA3P51805 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLXNA3P51805 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNA3P51805 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLXNA3P51805 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNA3P51805 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNA3P51805 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PLXNA3P51805 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXNA3P51805 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLXNA3P51805 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PLXNA3P51805 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNA3P51805 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNA3P51805 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNA3P51805 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNA3P51805 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PLXNA3P51805 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNA3P51805 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNA3P51805 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNA3P51805 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNA3P51805 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLXNA3P51805 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLXNA3P51805 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLXNA3P51805 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PLXNA3P51805 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXNA3P51805 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXNA3P51805 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNA3P51805 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNA3P51805 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNA3P51805 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNA3P51805 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNA3P51805 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNA3P51805 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLXNA3P51805 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXNA3P51805 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXNA3P51805 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLXNA3P51805 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLXNA3P51805 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLXNA3P51805 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLXNA3P51805 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PLXNA3P51805 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNA3P51805 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLXNA3P51805 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms