Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A9P48067 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC6A9P48067 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A9P48067 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A9P48067 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A9P48067 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A9P48067 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A9P48067 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A9P48067 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A9P48067 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A9P48067 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A9P48067 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A9P48067 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A9P48067 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A9P48067 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A9P48067 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A9P48067 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A9P48067 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A9P48067 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A9P48067 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A9P48067 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A9P48067 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC6A9P48067 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A9P48067 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A9P48067 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A9P48067 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A9P48067 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A9P48067 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A9P48067 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A9P48067 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A9P48067 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A9P48067 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A9P48067 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A9P48067 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A9P48067 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A9P48067 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A9P48067 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A9P48067 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A9P48067 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A9P48067 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A9P48067 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A9P48067 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A9P48067 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A9P48067 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A9P48067 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A9P48067 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A9P48067 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A9P48067 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A9P48067 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A9P48067 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A9P48067 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A9P48067 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A9P48067 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A9P48067 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A9P48067 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A9P48067 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A9P48067 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A9P48067 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A9P48067 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A9P48067 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A9P48067 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms