Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRCC3P46736 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRCC3P46736 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRCC3P46736 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRCC3P46736 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRCC3P46736 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
BRCC3P46736 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRCC3P46736 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRCC3P46736 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRCC3P46736 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRCC3P46736 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRCC3P46736 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRCC3P46736 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRCC3P46736 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRCC3P46736 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRCC3P46736 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRCC3P46736 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRCC3P46736 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRCC3P46736 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRCC3P46736 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRCC3P46736 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRCC3P46736 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BRCC3P46736 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRCC3P46736 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRCC3P46736 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRCC3P46736 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRCC3P46736 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRCC3P46736 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRCC3P46736 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRCC3P46736 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
BRCC3P46736 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRCC3P46736 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRCC3P46736 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRCC3P46736 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRCC3P46736 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRCC3P46736 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRCC3P46736 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRCC3P46736 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRCC3P46736 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRCC3P46736 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
BRCC3P46736 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRCC3P46736 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRCC3P46736 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRCC3P46736 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRCC3P46736 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRCC3P46736 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BRCC3P46736 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BRCC3P46736 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BRCC3P46736 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRCC3P46736 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRCC3P46736 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRCC3P46736 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRCC3P46736 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRCC3P46736 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRCC3P46736 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRCC3P46736 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRCC3P46736 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
BRCC3P46736 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
BRCC3P46736 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRCC3P46736 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRCC3P46736 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRCC3P46736 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRCC3P46736 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRCC3P46736 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
BRCC3P46736 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRCC3P46736 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRCC3P46736 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRCC3P46736 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BRCC3P46736 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRCC3P46736 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRCC3P46736 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRCC3P46736 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRCC3P46736 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRCC3P46736 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BRCC3P46736 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRCC3P46736 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRCC3P46736 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
BRCC3P46736 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRCC3P46736 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRCC3P46736 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRCC3P46736 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRCC3P46736 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRCC3P46736 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRCC3P46736 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRCC3P46736 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRCC3P46736 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRCC3P46736 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRCC3P46736 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRCC3P46736 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms