Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TXLNAP40222 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TXLNAP40222 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TXLNAP40222 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TXLNAP40222 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TXLNAP40222 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TXLNAP40222 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TXLNAP40222 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TXLNAP40222 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TXLNAP40222 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TXLNAP40222 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TXLNAP40222 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TXLNAP40222 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TXLNAP40222 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TXLNAP40222 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TXLNAP40222 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TXLNAP40222 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TXLNAP40222 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TXLNAP40222 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TXLNAP40222 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TXLNAP40222 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TXLNAP40222 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TXLNAP40222 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TXLNAP40222 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TXLNAP40222 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TXLNAP40222 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TXLNAP40222 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TXLNAP40222 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TXLNAP40222 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TXLNAP40222 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TXLNAP40222 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TXLNAP40222 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TXLNAP40222 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TXLNAP40222 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TXLNAP40222 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TXLNAP40222 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TXLNAP40222 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TXLNAP40222 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TXLNAP40222 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TXLNAP40222 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TXLNAP40222 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TXLNAP40222 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TXLNAP40222 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TXLNAP40222 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TXLNAP40222 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TXLNAP40222 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TXLNAP40222 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TXLNAP40222 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TXLNAP40222 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TXLNAP40222 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TXLNAP40222 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TXLNAP40222 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TXLNAP40222 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TXLNAP40222 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TXLNAP40222 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TXLNAP40222 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TXLNAP40222 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TXLNAP40222 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TXLNAP40222 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TXLNAP40222 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TXLNAP40222 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TXLNAP40222 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TXLNAP40222 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TXLNAP40222 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TXLNAP40222 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TXLNAP40222 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TXLNAP40222 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TXLNAP40222 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TXLNAP40222 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TXLNAP40222 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TXLNAP40222 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TXLNAP40222 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TXLNAP40222 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TXLNAP40222 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TXLNAP40222 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TXLNAP40222 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TXLNAP40222 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TXLNAP40222 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TXLNAP40222 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TXLNAP40222 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TXLNAP40222 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TXLNAP40222 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TXLNAP40222 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TXLNAP40222 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TXLNAP40222 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TXLNAP40222 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TXLNAP40222 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TXLNAP40222 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TXLNAP40222 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TXLNAP40222 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TXLNAP40222 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TXLNAP40222 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TXLNAP40222 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TXLNAP40222 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TXLNAP40222 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TXLNAP40222 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TXLNAP40222 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TXLNAP40222 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TXLNAP40222 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TXLNAP40222 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms