Protein–RNA interactions for Protein: P39905

GDNF, Glial cell line-derived neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDNFP39905 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDNFP39905 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDNFP39905 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDNFP39905 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDNFP39905 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDNFP39905 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDNFP39905 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDNFP39905 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDNFP39905 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GDNFP39905 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GDNFP39905 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GDNFP39905 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDNFP39905 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDNFP39905 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDNFP39905 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDNFP39905 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDNFP39905 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDNFP39905 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDNFP39905 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDNFP39905 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDNFP39905 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDNFP39905 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDNFP39905 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDNFP39905 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDNFP39905 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDNFP39905 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDNFP39905 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDNFP39905 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDNFP39905 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDNFP39905 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDNFP39905 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDNFP39905 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDNFP39905 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDNFP39905 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDNFP39905 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GDNFP39905 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDNFP39905 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDNFP39905 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDNFP39905 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GDNFP39905 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDNFP39905 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDNFP39905 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDNFP39905 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDNFP39905 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDNFP39905 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDNFP39905 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDNFP39905 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GDNFP39905 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDNFP39905 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDNFP39905 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDNFP39905 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDNFP39905 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GDNFP39905 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDNFP39905 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDNFP39905 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GDNFP39905 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDNFP39905 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GDNFP39905 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDNFP39905 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDNFP39905 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDNFP39905 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDNFP39905 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDNFP39905 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDNFP39905 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDNFP39905 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GDNFP39905 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDNFP39905 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDNFP39905 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GDNFP39905 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDNFP39905 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDNFP39905 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDNFP39905 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDNFP39905 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDNFP39905 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDNFP39905 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDNFP39905 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDNFP39905 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDNFP39905 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDNFP39905 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDNFP39905 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDNFP39905 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDNFP39905 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDNFP39905 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDNFP39905 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDNFP39905 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDNFP39905 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDNFP39905 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDNFP39905 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDNFP39905 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDNFP39905 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDNFP39905 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDNFP39905 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDNFP39905 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDNFP39905 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDNFP39905 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDNFP39905 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDNFP39905 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDNFP39905 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDNFP39905 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDNFP39905 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms