Protein–RNA interactions for Protein: P36980

CFHR2, Complement factor H-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR2P36980 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFHR2P36980 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFHR2P36980 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CFHR2P36980 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFHR2P36980 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFHR2P36980 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFHR2P36980 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFHR2P36980 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFHR2P36980 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFHR2P36980 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFHR2P36980 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFHR2P36980 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFHR2P36980 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFHR2P36980 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CFHR2P36980 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFHR2P36980 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CFHR2P36980 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFHR2P36980 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFHR2P36980 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFHR2P36980 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFHR2P36980 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFHR2P36980 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFHR2P36980 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFHR2P36980 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFHR2P36980 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFHR2P36980 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFHR2P36980 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFHR2P36980 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFHR2P36980 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFHR2P36980 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFHR2P36980 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFHR2P36980 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFHR2P36980 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFHR2P36980 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFHR2P36980 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFHR2P36980 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFHR2P36980 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFHR2P36980 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFHR2P36980 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFHR2P36980 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFHR2P36980 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CFHR2P36980 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFHR2P36980 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFHR2P36980 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFHR2P36980 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFHR2P36980 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFHR2P36980 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFHR2P36980 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFHR2P36980 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFHR2P36980 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFHR2P36980 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFHR2P36980 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CFHR2P36980 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFHR2P36980 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CFHR2P36980 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFHR2P36980 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFHR2P36980 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFHR2P36980 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFHR2P36980 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFHR2P36980 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFHR2P36980 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFHR2P36980 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFHR2P36980 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFHR2P36980 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFHR2P36980 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFHR2P36980 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFHR2P36980 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFHR2P36980 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFHR2P36980 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFHR2P36980 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFHR2P36980 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CFHR2P36980 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFHR2P36980 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFHR2P36980 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFHR2P36980 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CFHR2P36980 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFHR2P36980 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms