Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGER1P34995 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGER1P34995 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGER1P34995 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGER1P34995 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGER1P34995 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTGER1P34995 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTGER1P34995 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGER1P34995 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGER1P34995 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGER1P34995 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGER1P34995 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGER1P34995 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGER1P34995 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGER1P34995 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGER1P34995 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGER1P34995 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTGER1P34995 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGER1P34995 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGER1P34995 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTGER1P34995 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGER1P34995 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGER1P34995 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGER1P34995 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGER1P34995 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTGER1P34995 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGER1P34995 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTGER1P34995 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGER1P34995 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGER1P34995 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGER1P34995 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTGER1P34995 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGER1P34995 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGER1P34995 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGER1P34995 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTGER1P34995 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGER1P34995 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTGER1P34995 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTGER1P34995 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGER1P34995 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTGER1P34995 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGER1P34995 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGER1P34995 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGER1P34995 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGER1P34995 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGER1P34995 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGER1P34995 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGER1P34995 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGER1P34995 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGER1P34995 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTGER1P34995 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTGER1P34995 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGER1P34995 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGER1P34995 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGER1P34995 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGER1P34995 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTGER1P34995 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGER1P34995 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGER1P34995 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTGER1P34995 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGER1P34995 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTGER1P34995 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER1P34995 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTGER1P34995 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER1P34995 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER1P34995 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER1P34995 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER1P34995 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTGER1P34995 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGER1P34995 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGER1P34995 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTGER1P34995 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER1P34995 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER1P34995 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER1P34995 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER1P34995 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTGER1P34995 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER1P34995 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER1P34995 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER1P34995 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER1P34995 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTGER1P34995 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGER1P34995 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTGER1P34995 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTGER1P34995 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTGER1P34995 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGER1P34995 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTGER1P34995 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGER1P34995 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGER1P34995 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGER1P34995 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTGER1P34995 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGER1P34995 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGER1P34995 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGER1P34995 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTGER1P34995 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGER1P34995 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTGER1P34995 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER1P34995 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTGER1P34995 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms